在小赫的說服下大鬍子終於決定調整自己的劇本，並且由於主角團的三人組分別由娜姿的寶可夢飾演，那麼剩下的寶可夢大鬍子乾脆也沒有往外找，直接從小赫和娜姿的寶可夢裡試鏡。
在一番精心的準備之後，正式定稿名爲《皮卡丘騎士：復國的公主》的電影劇組正式開拍。
“第一幕，action！”
清晨的陽光從木窗照進室內，皮卡丘從小木牀上爬起，在木屋外赫拉克羅斯爺爺正在劈柴。
皮卡丘找到赫拉克羅斯說出自己想要離開故鄉到外面去冒險，赫拉克羅斯關心孫子心切自然不會同意，於是雙方決定只要皮卡丘能夠打敗赫拉克羅斯它就可以離開。
簡單的交代玩主角的身份背景之後就是這部電影的第一場打戲了，因爲在這個故事中皮卡丘的身份是騎士，所以在戰鬥時要表現出更多騎士戰鬥的樣子。
按照大鬍子原本的想法，他是打算讓皮卡丘和赫拉克羅斯各自拿上一把木劍戰鬥，但是這個想法被小赫和娜姿否決了。
小赫：“既然是寶可夢的電影如果完全按照人類的思維去設計會很古怪的吧？”
娜姿：“爲什麼不試着用寶可夢絕招呢？”
在兩人的堅持下這場戰鬥改成了寶可夢的對戰，當然既然是電影要讓寶可夢的行爲更加人性化自然不能像寶可夢戰鬥一樣你一下我一下，於是乎小赫和娜姿彼此討論了一番之後決定各自給自己的寶可夢選擇一個有標誌性的絕招，然後進行戰鬥。
於是乎在這第一場的戰鬥裡，皮卡丘變成了一個以鋼鐵尾巴當作劍來戰鬥的騎士，而赫拉克羅斯則以劈瓦爲主，兩隻寶可夢一個以尾巴爲劍，一個用利爪當刀打得似模似樣，頗有種中古世紀騎士決鬥的意思。
最終第一場戰鬥以皮卡丘利用電光一閃加上鋼鐵尾巴打敗使用出最強絕招百萬角擊的赫拉克羅斯結束，獲得勝利的皮卡丘得到了爺爺的認可終於可以離開村子。
畫面在赫拉克羅斯、比雕等一衆寶可夢目送皮卡丘踏上離開山村的小路後暫時落幕。
電影的第二幕講的是男女主的相遇，作爲王國的公主胖丁有着可以通過歌聲給人帶來幸福的力量，但這並不能幫助它逃出邪惡的大嘴雀和拉達的追趕。
幸運的是皮卡丘恰好在這個時候出現，先是用鋼鐵尾巴擋下大嘴雀用羽毛舞絕招射出的羽箭，隨後有用電光一閃正面將拉達擊退。
胖丁公主唱起祝福的歌曲給皮卡丘帶來強大的力量，在公主的幫助下兩人成功的打敗了追兵，逃到森林之中，第二幕結束。
電影的第三幕，耿鬼終於正式出場。
作爲電影裡一個主要提供笑點的反差型角色，耿鬼的第一次出場是在村子的通緝令上，某個村子裡的老婆婆大奶罐用牛奶懸賞耿鬼，因爲它騙走了自己的孫女吉利蛋，
於是乎皮卡丘和胖丁就踏上了征討耿鬼的道路，在一場精疲力盡的大戰之後耿鬼終於被兩人打敗，被打敗的耿鬼乖乖求饒並放出被‘綁架’的吉利蛋，原來耿鬼只是因爲貪吃大奶罐婆婆的牛奶纔想着騙走奶奶的孫女。
在逼着耿鬼向大奶罐他們道歉之後，皮卡丘和胖丁繼續前進，不過這一次耿鬼主動跟了上來表示要跟它們一起冒險，愛惡作劇的魔法師耿鬼加入隊伍。
主角三人組集合之後它們又一起陸續解決了兩三個小任務，此時電影的劇情已經走到一半，是時候把故事的主線推出來了。
於是乎在接下來的一座城鎮中，三人組看到了胖丁的通緝令，在一番誤會與和解之後，有了兩個同伴關心的胖丁終於說出了實情，電影的主線正式出場，那就是打敗邪惡的神官素力柏。
三人組悄悄的潛入王城，找到神官居住的地方準備發起偷襲，但神官早有準備召集手下將他們團團包圍，關鍵時刻作爲隊伍裡唯一的魔法師耿鬼出手騙過敵軍讓大家趁亂逃走，但耿鬼也因此受了重傷，只有傳說中海外的神才能治好。
於是又是一系列的冒險，他們終於在海島上找到了大海之神洛奇亞，洛奇亞表示想要救下耿鬼就要通過它的考驗，然後又是一連串的艱難考驗，他們終於打動了洛奇亞，耿鬼被救活，同時得到了神的嘉獎的他們獲得了新的能力作爲獎勵。
升級歸來的冒險三人組全副武裝再次向邪惡的神官發起挑戰，他們偷偷化妝參加了王國的挑戰賽，然後在邪惡神官出席決賽的那天當着整個王國的人的面與神官戰鬥，最終皮卡丘騎士憑藉神教給他的瘋狂伏特絕招打敗了邪惡的神官，爲這一場冒險畫上最後的休止符。
“卡！”大鬍子結束拍攝興奮的衝到皮卡丘面前大聲道：“太棒了，你簡直就是我見過的最有天分的演員，相信我這部電影一定會讓你成爲最出名的寶可夢明星！”
“明星什麼的無所謂，我只想知道這電影到底什麼時候可以上映？”小赫好奇的道。
“放心吧，這部電影無論是劇本的打磨，還是大家的表演都近乎完美，還有你提供的圖鑑式攝影機也非常棒，這些畫面基本上可以直接拿來用，這麼高的完成度距離電影上映不會太遠的，只是……”
“只是什麼？”娜姿連忙問。
“只是我一時激動拍了太多精彩的畫面了，每一個片段都是那麼的精彩，眼看超出一部電影的限制太多，我一點都捨不得刪減怎麼辦？”
“那個這我們就沒有辦法給你建議了，畢竟這部電影的導演是你，所以最終這部電影會是什麼模樣全部要拜託導演你了。”
“包在我身上好了，你們就等着聽我的好消息吧，電影上映的那天我會打電話給你們的。”
“那就拜託你了。”
告別了大鬍子導演，小赫他們也該爲下一場華麗大賽做準備了，因爲皮卡丘拍電影花了一個多星期的時間小智他們都已經拿完徽章準備迎接下一站的挑戰了，小赫和娜姿自然不能再錯過。
“下一站，凱那市！”