陸洪濤被帶到彭光烈指揮部，彭光烈一問大驚他意識到自己擊潰了陝甘一鎮主要是將統制給活捉了。便馬上找了五十人將他們押到成都。
孫兆鸞這時率兵四千多人已奪回數地。並直逼昌都。
昌都貌似是入藏必打之地，歷朝歷代皆如此。
昌都集中了兩千名全副英式裝備的親英藏軍，主帥是達賴，他下令：全軍等川軍靠近後開槍，節省彈藥。
孫兆鸞率兵準備夜襲藏軍陣地。晚上，藏軍陣地上士兵懶散地倒在戰壕裡。
兩個藏軍士兵用藏語在戰壕裡交談：“聽說川軍殺人比狼還可怕。”
另一個藏兵輕蔑地說：“只要他們是人我就不怕他們。“那個藏兵說完還帶有一絲輕蔑地笑了笑。
這時一羣川兵悄悄地衝入戰壕，用手捂住藏兵的嘴並一刀殺掉，正殺着，一個藏兵看到後馬上朝天開了槍，所有藏兵驚起。
孫兆鸞看後掏出佩槍並大聲說：“開槍打”。
說完，一陣槍響，對方也開槍還擊。川軍士兵不斷倒下，藏兵那邊也好不到那兒去，也倒下了一大片。達賴身穿英式軍裝，在指揮部頂上用望遠鏡看着一切。
達賴看到藏軍士兵有些不利，便馬上用藏語對身邊的副官道：“快讓炮兵朝川軍開炮。”
那個副官猶豫道：“若開炮會傷着自己人。”達賴聽後拔出英格蘭將刀，說：“不去者死。”“是”。
可命令傳到炮兵那兒，炮兵不樂意了。你現在下狠心殺他們，以後就有可能殺自己。於是炮兵們決定造反。
兩門英造阿姆斯特朗12英寸後裝填彈式加農炮齊朝達賴指揮部同時開炮。兩炮同時命中指揮部，達賴被氣浪衝飛，整個指揮部標炸成碎片。
藏兵剩下的一千三百多人全部投降。達賴要爬着逃。而被一個川兵發現沒死，便朝達賴開了一槍，達賴當場斃命。
此戰川軍大勝僅戰死一百人，傷五十人。繳獲英造阿姆斯特朗12英寸後裝填彈式加農炮2門，英造士乃得步槍兩千支。
隨後川軍向拉薩進軍。種穎得知後大驚馬上派兩千川軍與一萬多藏軍（全抓的壯丁）在拉薩附近設防。
在拉薩清軍陣地，種穎身穿清朝八旗正黃旗棉甲，種穎還臨時修築了八個炮兵陣地（一陣地2門法造過山炮）。二十四挺馬克沁重機槍齊擺在主陣地上。種穎命炮兵一旦川軍進攻，馬上開炮。
十三世班禪聽到川軍所佔藏地情況後，決定殺了種穎然後歸順四川。並召集了二十個勇士準備行刺。
而班禪的手下大臣扎西讓反對道：“如今決不可衝動，看川軍與清軍怎麼打，如果川軍勝了，咱們再宣佈藏地歸誰。絕不可貿然行事，如今錯一步便會死無葬身之地。三思啊？”班禪聽後覺得有道理便聽從他的話。
20日，孫兆鸞率兵共四千多人已到拉薩附近。並定下戰策：64標與新兵一千多人全上刺刀衝上去，剩下的人準備。因爲孫兆鸞知道清軍有16門法造過山炮，所以才這樣。
晚8點，總攻開始了，三千多名身穿土黃色軍裝的川軍士兵衝向藏兵陣地。
那兩千川軍與一萬多藏兵全被川軍的吶喊聲驚了，因爲又是晚上，所以藏兵炮亂打，槍亂開。並且還發生了一個搞笑的事：一個炮兵陣地你說你亂放炮就亂放吧，竟吃飽了撐的朝藏軍一個陣地連開了兩炮，並且全部命中，那個陣地是種穎將所有主力全集中在那個陣地上，那支主力沒打上川軍，反而讓自己人的兩炮給全打沒了。
只見藏軍主陣地捱了兩炮後，機槍，步槍，屍體亂倒。而川軍士兵衝了上去，向藏軍一陣亂砍。那些藏兵被炮打懵了，早就已經不行了，再讓川軍這一陣亂砍。這支軍隊馬上就潰了。
大軍大敗，潰兵全逃向都統府，陣地上的藏軍跑的票額，投降的投降。
孫兆鸞又打了勝仗。他讓這些降兵全到藏軍軍營。班禪聽後大喜，連忙帶人前去迎接川軍。孫兆鸞命64標本部包圍都統府。並帶剩下的部隊前往班禪宮。
在都統府，潰兵狼狽不堪的守着都統府。種穎爲體現其貴族精神（其全名爲愛新覺羅.種穎算是個滿清貴族吧），決定率潰兵衝出去突圍。他召集所有士兵道：“全軍準備，殺出去。”
而這些人已無心再戰，一個從肩章上看爲協參領軍銜的軍官，大喊：“川人不打川人，老子不打了。”說完，引起士兵們的贊同。
種穎馬上朝那個軍官開了一槍，這一槍，可就引起這些兵的不滿了。人家給你賣命，你還開槍打人家，你當人家是傻子啊，不反你龜兒子纔怪呢！
這些士兵馬上子彈齊上膛，齊朝種穎開槍，那時大概有一千人一千發子彈齊射向種穎。那場景可以想象：種穎的正黃旗棉甲被血染成了紅色。
種穎死的時候連眼睛都沒來得及合上，就倒地死了。那一千名士兵全部投降了川軍。
孫兆鸞與班禪會合後，他派會藏語的人對班禪用藏語宣讀尹昌衡的信。
信中內容大致爲藏地實行自治，四川不派任何川軍駐藏，還會派人幫忙訓練士兵，但還要爲川軍組建兩個藏兵鎮。在西藏建學校，建工廠。藏地改爲西藏自治署。由班禪任自治署統，全藏稅收每月一半上交四川，一半納入自治署府用於日常開支，同時授班禪少將銜。
班禪聽後十分滿意的點了點頭，表示願意遵守都督意。孫兆鸞率兵暫駐藏地，以防英國干涉軍。