在袁世凱的秘密暗示下，馮國璋被北洋悍將在京城發動兵變，清廷統治搖搖欲墜，皇室中人嚇得六神無主。2月12日，在袁世凱等人的逼迫下，清廷隆裕太后代宣統皇帝頒佈了退位詔書，清王朝宣告滅亡，中國兩千多年的君主專制制度也隨之結束。
在宣統皇帝宣佈退位之後，袁世凱和孫文就南北和談最終問題用電報進行了長時間的商談，孫文表示只要袁世凱擁護共和，使清帝退位，自己願擁他爲總統。至於都城問題，孫文認爲南京和北京都是可以的，但他內心更傾向於南京。袁世凱逼清帝退位後，孫文便按照約定提出辭職，請袁世凱來代替，不過孫文向袁世凱提出了三個條件，其中的兩個條件與定都南京有關：一是臨時政府地點設於南京，二是新總統在南京就職，想把袁世凱置於南方革命派的監督和控制之下。除此之外，日本方面當時對文的影響也是一個不容迴避的問題。辛亥革命之際，對中國南、北政權均有特別影響的日本朝野，則多主張中國的政治中心放在南京。日本方面的出發點很清楚，它是想借中國政治中心南移的機會，削弱中國在北方的防禦，便利其對滿蒙的侵略擴張。
在參議院(以同盟會員爲主)討論此問題時，主張建都北京的佔20人，主張建都南京的只有8人，只是在孫中山和黃興等人的一再堅持下，參議院複議時才確定了南京。
然而從袁世凱這方面來說，他是根本不願離開自己勢力強大的北方而到南方受制於革命派。而北洋集團的將領們也不願將中國的政治中心南移。
從客觀上來說。蕭震雷認爲定都北平要比南京要好，在政治上。定都北平是各省大多數代表們的意願；另外，在日本帝國主義處心積慮地想吞併東北的情況下。維持北平政治中心的地位，有利於制約日本和俄國，並抑制了復辟勢力，使其最終沒有形成氣候。從軍事角度上來說，南京不利於防守，而且緊靠長江，帝國主義的軍艦可以對南京直接構成威脅。
不過蕭震雷對定都的問題沒有發表任何意見，他不想被革命黨人孤立，此時也不能和同盟會這邊鬧翻。
就在同盟會這邊就定都的問題與袁世凱打嘴仗的時候。蕭震雷正在着手對各省駐留在南京城外的軍隊進行遣返工作，爲了防止袁世凱翻臉不認人，蕭震雷認爲還是要繼續保持足夠的軍隊爲好，他決定將各省在南京的軍隊大部分遣返，另外留下一些精銳編成一個師。
可這個時候偏偏發生了一件震驚中外的大事。2月19日，荷屬爪哇島泗水市華僑，紛紛走上街頭，舉行集會，升起五色旗。鳴放爆竹，慶祝中華民國的成立。荷蘭殖民當局竟派軍警武力干涉，開槍打死華僑三人，傷十餘人。百餘人被捕。憤怒的華僑採取閉門罷市的行動以示抗議，荷蘭殖民當局進而出動大批軍警強迫開市，又逮捕千餘人。釀成轟動一時的“泗水事件”。
蕭震雷收到消息之後異常憤怒，立即以臨時政府的名義派人與荷蘭公使接觸。並表示嚴正抗議，要求荷屬殖民當局立即釋放被捕的華僑並對死難的華僑進行公開道歉和賠償。否則保留追究的權力。
然而荷蘭當局並未重視，對蕭震雷的警告不理不睬，蕭震雷等了幾天未見到任何迴應，當即惱了，他決定先斬後奏，一面向大總統孫文提出軍事幹預行動的計劃，一方面下令海軍艦隊南下向澳門港進發，同時下令浙江第一軍兩個師西進福建向廣東進軍。
於此同時，蕭震雷代表軍方召開新聞發佈會，宣佈如果荷蘭當局不在三天之內給出滿意的迴應，他將下令軍隊進攻澳門，逮捕在澳一切荷蘭公民。
新聞發佈會的召開引起了巨大的反響，袁世凱那邊暫時還沒有動靜，不過同盟會革命黨於2月26日召開了總統府會議，並讓蕭震雷參加，指着他不該越過臨時政府擅自與荷蘭公使接觸。
“蕭寰宇，你想幹什麼？外交上的事情是臨時政府的事情，不是你們軍方該過問的，你擅自越過臨時政府外交部與荷蘭公使進行接觸是越權行爲，你這是藐視我們外交部，也是藐視臨時政府！”
蕭震雷不屑地瞟了說話那人一眼，輕蔑地冷笑道：“我就是藐視你們、藐視臨時政府怎麼啦？你能把我怎麼樣？”
不少人聞言臉色劇變，那人立即對孫文道：“大總統，你看着蕭寰宇囂張跋扈，完全不把我們這些人放在眼裡，不把大總統放在眼裡！”
蕭震雷恥笑，“行了，別把大總統牽扯進來，你們不敢跟洋人挺起腰桿說話也就罷了，卻在這裡數落我的不是，如果說英法俄德美日等過是列強，你們不敢招惹，別人也許不會說什麼，可一個小小的荷蘭都把你們這羣傢伙嚇成這樣，我看你們這個官做與不做都沒什麼區別，何必浪費百姓們的賦稅養你們這些蠹蟲呢？海外華僑雖然已不是我中華公民，我們血液裡流淌的是同一個祖宗的血脈，同宗同源，大總統就曾經說過，華僑乃革命之母，當我們在爲革命募捐的時候，是華僑們拿出自己辛苦賺來的血汗錢支持我們革命，難道你們這些人都忘了嗎?現在我們推翻了滿清王朝，成立了臨時政府，華僑們卻因爲舉行慶祝儀式遭了難，而我們臨時政府卻不管不問，這算什麼？翻臉不認人還是過河拆橋？可悲啊！以後你們再去募捐，我看誰還會搭理你們！”
在蕭震雷的話音落下後，會議室裡一片寂靜，有的只有香菸的氣味瀰漫在空氣中，所有人都沉默不語，沒有人一個人大聲的呼吸。會議室裡的人都知道，蕭震雷說的是對的，不能不管那些泗水華僑們，沒有他們的支持，革命沒有今天的成就，幾個月前，在座的這裡有些人就是從那便回來的。
良久，孫文問道：“寰宇，你，有幾分把握？你真的有辦法讓荷蘭人屈服嗎？你要知道這可不是兒戲，我們國內尚未平靜，如果又招惹外地敵，稍有不慎會讓整個國家陷入不利的境地啊！”
蕭震雷見孫文這麼問，就知道他已經被說動了，連忙道：“大總統放心，我這是經過深思熟慮的，現在西方列強之間在互相牽制，沒有誰能夠騰出手來管我們的閒事，荷蘭人從前倒的確有些令人害怕，但是現在他們不行了，他們在遠東和南亞地區的軍事力量有限，如果不是各國力量互相牽制，荷蘭人根本保不住荷屬東印度，我們以拿下澳門爲威脅以及宣佈之前所有與荷蘭人簽訂的協約爲威脅，不愁荷蘭人不低頭，他們在荷屬東印度雖然還有幾條破船，但都是一些老舊船隻，如果他們不顧一切將這幾艘老舊戰船開到遠東來，擊中我國現在的海軍力量完全可以與他們一戰，另外我們之前在英國訂購的幾艘戰艦也已經可以交付了，我認爲可以命程璧光迅速率艦隊返回，如果荷蘭人把荷屬東印度的艦隊傾巢而出對我們，可以命令程璧光從後面襲擊荷屬東印度港口，搗毀他們的老巢，再配合我們前後夾擊它的艦隊！如果有其他國家的公使來找大總統對您施加壓力，您完全可以把這件事情推給我，就說是我在負責這件事情，讓他們來找我好了，對付洋人，這是我最喜歡乾的事兒！”
衆人聞言面面相覷，不少人聽了蕭震雷的話都有些羞愧，孫文經過縝密的考慮，決定蕭震雷的建議，立即正式以南京臨時政府的名義與荷蘭當局交涉。並且在此次會議上議決對荷蘭交涉的四項條件:一、限三日內釋放被捕華僑；二、賠償財產損失；三、對被害者給予賠償；四、恢復人權，華僑與歐僑和日僑一律對待。同時指出“如無滿意答覆，民國自有相當之對待”。
臨時政府外交部立即就此四項條件通知荷蘭外交部，並將對荷交涉的四項條件電告北平當局，可袁世凱依然沒有站出來。
很快在蕭震雷的主持下，成立了華僑聯合會，成爲臨時政府聯絡海外華僑和處理華僑事務的得力助手，進一步密切了華僑與祖國人民間的聯繫。
泗水慘案發生之後，華僑們分別致電北京晚清政府、南京民國臨時政府和上海華僑聯合會，請求保護。泗水華僑遭受不公正對待的消息傳至國內，引起國內朝野各界的廣泛關注，維護華僑合法權益的呼聲響徹華夏大地，在羣衆的憤怒聲援下，南京臨時政府採取了積極的護僑行動。
三天後，荷蘭當局並沒有迴音，在蕭震雷的命令下，兩個師的部隊迅速開往廣東，並且海軍艦隊開始集結向澳門海域進發，誰也沒有想到蕭震雷這麼做還有另外一個目的，就是將軍隊開進廣東境內，以達到控制廣東的目的。