就在朱常洛醉生夢死的時候，南京卻發生了一件足以改變整個大明局勢的事情。
晨光微曦當中，薄霧籠罩的六朝金陵往日繁華的江邊碼頭已經開始了一天的忙碌，隨着山東和北京的局勢變化，原本作爲長江航運中轉碼頭的南京，是比不上青島天津以及松江這樣的海運碼頭的，不過隨着北方局勢變化，這讓南京重新煥發了青春，每天天不大亮，碼頭上便有無數的商船靠岸，甚至還有經過市舶司特許的荷蘭人船隻，到南京來進行交易，當然這也給了無數依靠碼頭營生過活的腳伕和裝卸工機會，這些人的工錢從一天的五十文銀子，直接漲到了一錢，甚至是五錢，直接漲了十倍。
然而今天，幾個碼頭工人看到，在遠處晨霧當中一艘龐大的戰艦輪廓漸漸清晰起來，他們已經看到了那長長的伸出去炮管和特殊的飛剪式艦艏造型，那是最新的海王級鐵甲艦早會有的特殊造型，這讓那些滿心歡喜想要上前攬活的碼頭工人有些驚疑不定，這些應該都是南海艦隊的主力戰艦，理應去打天津這樣的南方城市在，怎麼來到南京了。
跟普通百姓的驚疑相比，如今南京六部的官員，可就更加不安了，如今北京形勢不明，他們南京六部的分量就大大加重了，不過南京六部的人大部分可都是東林黨派的，實際上是讓北京的大學黨給趕出來的，他們看到北京六部和內閣都換了一茬，明顯其中有蹊蹺，這些人雖然表面上憂國憂民，實際上卻也是心中暗喜，您看，剛剛把我們趕出北京城，你們馬上就倒黴了。
不過此時朱由崧的軍艦突然來到南京港，他的來意是什麼？太子挾持了北京六部，難道你就要挾持南京六部？
如今的南京戶部尚書正是周嘉謨，與北京六部當中，吏部爲六部之首不同，南京六部戶部和兵部的權威最重，戶部負責徵收浙贛湘鄂之地的稅糧，這四地的稅糧幾乎佔了大明朝稅糧的一半，還有漕運和全國鹽引勘合事務，而南京兵部下面則有49個衛所，而其他的吏部，卻只是負責南京地區的官員考察，刑部工部禮部原本就不是什麼實權部門。
南京戶部尚書周嘉謨如今正是南京六部的爲首之人，因而南京碼頭出現了這樣一艘戰艦，自然是讓他們心驚肉跳，不得不齊聚在周嘉謨府中問計，不過此時周嘉謨也是什麼情況都搞不清楚，又能有什麼法子給他們開解，只能安慰道：“諸位不用擔心，不論是誰，我們都不會有什麼事情的！”
沒有經歷過真正的戰亂，只是懂得官場爭鬥的這些人，在真正的軍隊面前，還是顯得如此的軟弱，不過很快被排出去打探消息的僕人小廝就帶回了消息，那小廝不過十三四歲，一張小臉紅通通的，氣喘如牛，想說話卻也說不出來，周嘉謨連忙說道：“不要急，慢慢說！”
等那小廝平息下來，才說道：“老爺，不好了，上岸了……上岸了！”
周嘉謨罵道：“給我說清楚，什麼上岸了！”
“皇上！那是皇上的儀仗！”小廝連忙說道：“我看到那碼頭上有六匹馬拉着大馬車，我聽老爺說過，天子六駕，我看到了上岸的馬車就是六匹馬拉的，而且馬車上都是明黃色的錦緞，繡着五爪神龍！”
周嘉謨臉色一變，那戰艦明顯是北海王的戰艦，這次他居然使用天子儀仗，難道還真要逼迫他們擁他爲王，在南京與太子對峙？
“出去看看！”周嘉謨等人魚貫而出，各自坐上馬車，來到中華門前，此時中華門已經聚集了大量看熱鬧的百姓，不過周嘉謨等人下車之後臉色就更加難看了，他們所看到的儀仗與那小廝又有所不同。
那車輅以明黃色爲裝飾，圓蓋上鑲嵌市玉園板，使用青緞幨帷，圓盤垂有鏤金垂雲，四周貼有三層鏤金雲版。幨帷用三層青緞製成，每層繡有金雲龍羽紋相間。四根金青緞繫帶綁在車軫上。四柱上繪有金色雲龍。車門垂珠簾，四面各三。雲龍寶座四周爲朱欄，以金彩相間塗飾，欄內四周布有花毯。兩輪各有十八根車輻，以金色鏤花裝飾。前有兩根軸轅，兩端分別飾金龍的頭和尾。後樹有青緞太常旗十二面，旗面上分別繡各有日月五星、二十八星宿，旗下垂有五彩流蘇。
這分明是皇帝玉輅，是皇帝的郊祀車架之一，雖然萬曆皇帝並不常上朝，但是大朝會的時候，就會將玉輅陳設在午門之外，因此周嘉謨等人對玉輅並不陌生，況且他們都是熟讀經書之輩，這等禮儀的知識已然是熟得不得再熟的東西，而且在皇帝五輅當中，又以玉輅最爲珍貴，這次朱由崧前來，居然是乘坐這種天子車駕，價值就是大逆不道。
“這些老朱家的子孫，一個比一個混賬！”周嘉謨在心中不禁暗罵：“北京剛剛發生了政變，萬曆皇帝生死未必，太子跟這個北海王，居然一個接一個地要當皇帝，這位被海王可是還有父王在世的！”
“不知車中何人，居然敢用太子車駕！”周嘉謨等人還沒等站出來，就看一個不到二十的少年站出來擋在了車駕之前喝道。
“怎麼停了下來，還沒到六部呢，還真有人敢擋我啊？”朱由崧從天子玉輅當中鑽了出來，不過他身上只是穿了一身蟒袍，並沒有穿龍袍，這讓那名少年倒是放下心來，朱由崧直接坐到車沿上，道：“你是什麼人？我做我的馬車，關你何事？”
“在下廣東南海陳子壯拜見殿下，如今殿下身爲一藩王，卻是用天子車駕，於理不合，還請殿下更換車駕！”陳子壯義正言辭，面對周圍荷槍實彈的士兵，仍然面不改色。
這倒是讓朱由崧十分欣賞此人，看了看四周，不遠處就是那身穿硃紅官服的周嘉謨等人，於是笑道：“原本我打算是到奉天殿再說的，不夠既然人都到了，就在這裡說吧！”
“周大人，鄒大人，陳大人，皇上在此，爲何不過來拜見？”朱由崧高聲叫道。
既然被朱由崧點了出來，周嘉謨帶着一干官吏來到朱由崧面前，很多人甚至怒視着朱由崧，在他們看來，朱由崧此舉無疑是野心暴漏的表現，周嘉謨卻平靜地說道：“王爺，不知道皇上何在？難不成王爺已經登基？”
朱由崧笑道：“周大人，你也曾經做過吏部尚書，應該是見過我皇爺爺吧？”
周嘉謨點了點頭，說道：“雖然皇上多年不朝，不過一些祭祀禮儀還是要參加的，下官自然加過皇上！”
朱由崧索性揭開玉輅的帷幔，將萬曆帝攙扶了出來，笑道：“既然周大人認得皇上，那麼見到皇上爲何不跪？”
“皇上？你怎麼會……”面對突然出現在他面前的萬曆皇帝，周嘉謨不禁有些手足無措。
萬曆帝蒼老而沙啞的聲音說道：“周卿，這也是天家家門不幸，當日我要廢黜太子，那逆子便已經心生不忿，與遼東李如柏和閹人徐誦勾結，那徐誦原本就是通緝要犯，他卻一直庇護，以至於沒辦法將之繩之於法，而且這次居然將京營大軍調出北京，發動政變，若不是經樞密院忠良相救，恐怕也已經身陷宮中，只可惜如今北京六部和內閣諸卿都陷入逆子手中，怕只怕……”
實際上在南京擔任官職的人，大部分都是因爲在北京政治鬥爭失敗，而來到南京擔任閒職的人，很多甚至還曾經身居高位，因此認識萬曆帝的人也不在少數，而且還有成敬、鄭貴妃等人一起出面，萬曆帝的身份已經確認無疑。
萬曆帝在南京重新回到皇宮之後，南方西北等地的省份也都紛紛表示臣服，並且願意出兵討伐朱常洛，不過都讓萬曆帝給駁了回去，他明白這次動盪地卻是讓大明朝廷的威嚴受損，如果讓各省督撫出兵，必然會增加各地方官的權力，而且萬曆帝也對朱由崧訓練出來的軍隊有信心，因此決定只用京營來收復北京。
然而朱由崧接下來要他宣下去的幾道旨意卻讓萬曆帝有些疑惑，改革議會，設立憲法，這兩件事情幾乎是把皇帝“批朱”的權力，收到了議會當中，那身居內宮的皇帝還會有什麼權力？
“崧兒，這議會的權力太大， 就不怕……”
朱由崧笑道：“皇爺爺，議會的權力並不是在一個人手中，如果議會變成了口徑一致只會鼓掌的議會，那就只是個擺設，絕對不會有任何權力，況且我們皇家雖然放棄了批朱的行政權力，不過卻掌握了樞密院，憲法上明確規定了，皇帝是樞密院的最高領導，樞密院各部直屬於皇帝領導，這樣就足夠了！”
萬曆帝點了點頭，突然笑了笑，說道：“只要將兵權握在手中，放棄批朱也沒什麼不可，我們不管這些行政手段了，正好百官也沒辦法向我頭上扣帽子了，若是民間再民不聊生，那就是他們的責任了！”
朱由崧笑道：“正是如此！”