第五艦隊在隱蔽海域活動了兩天，到十三日凌晨的時候，斯普魯恩斯突然下了一道緊急命令，艦隊立即離開隱蔽海域，以16節的速度向西航行。米切爾與特納立即發來了電報，詢問爲什麼要向西航行，斯普魯恩斯沒有給兩個部下說明自己的意圖，只是讓他們兩支特混艦隊跟上來，並且讓艦載航空兵做好戰鬥的準備工作。
兩日的等待讓斯普魯恩斯有了更多的時間來思考下一步的作戰行動，最終讓斯普魯恩斯修改作戰計劃還是一封來自珍珠港的電報。這是由尼米茲發來的電報，斯普魯恩斯派到考愛島去的飛機把他的要求帶到了，尼米茲沒有限制斯普魯恩斯的行動，而且還按照斯普魯恩斯的要求，讓考愛島上的美軍暫時停止了反擊準備，轉入全面防禦狀態。同時，尼米茲也提出了新的要求，如果無法擊敗唐帝國海軍的主力艦隊的話，就應該考慮打擊唐帝國海軍的後勤保障系統，使其前線作戰部隊得不到足夠的物資，拖延唐帝國海軍陸戰隊的進攻速度。顯然，尼米茲降低了對第五艦隊的要求，這也表示尼米茲也認識到，要想在海面上擊敗唐帝國主力艦隊的難度。
正是這封電報讓斯普魯恩斯認識到了一個他之前一直忽略了的問題，那就是唐帝國海軍的後勤保障系統。唐帝國海軍在中太平洋上投入了六支主力特混艦隊，戰區艦隊，還有配屬與陸戰隊的龐大的支援艦隊。另外，還有十幾個師的陸戰隊，龐大的岸基航空兵，前線炮兵等等，這些全都算上去，需要多少的作戰物資？而軍隊如果失去了作戰物資的支持的話，就不可能獲得勝利。因此，打擊對方的後勤保障系統應該是遏制唐帝國海軍進攻地最有效的辦法之一。
在十二日上午收到了尼米茲的電報後，斯普魯恩斯也看到了一線希望。當時談仁皓與黃曉天的艦隊還沒有分開，考愛島那邊也沒有發來更多的消息，斯普魯恩斯判斷唐帝國海軍的兩支主力艦隊仍然在一起活動，這使他放棄了偷襲唐帝國主力艦隊的想法，轉而考慮怎麼打擊唐帝國海軍的後勤保障系統。
當天下午，斯普魯恩斯就收到了另外一封情報。這是由美國海軍情報系統提供地，多艘潛艇都證實，唐帝國海軍的運輸船隊在到達了中途島之後就直接返回了關島，而向前線運送物資的是另外幾支船隊。顯然，中途島是整個唐帝國海軍前線作戰物資的囤積與週轉中心，所有由後方運送到前線去的物資都需要先在中途島卸貨，再次裝船，最後運出。這也與之前唐帝國海軍的主力艦隊集中在中途島附近活動的情況完全吻合。
這封情報讓斯普魯恩斯產生了一個極爲大膽的想法，即偷襲中途島，炸掉唐帝國海軍囤積在中途島上的物資。這樣。唐帝國海軍陸戰隊攻打考愛島的行動將被徹底瓦解，至少能夠拖延住唐帝國海軍陸戰隊的進攻步伐。
相對而言，偷襲集結在考愛島附近的登陸艦隊。以及往返與考愛島與中途島之間的運輸船隊的風險是相當巨大地。登陸艦隊受到了重重保護，且支持登陸作戰的支援艦隊一直沒有離開，幾十艘護航航母上的戰鬥機不可小看。而往返的運輸船隊一直在岸基戰鬥機的掩護下活動，不要說讓艦隊去偷襲，就連潛艇都難以偷襲這些運輸船隊。更何況，斯普魯恩斯無法及時的掌握這些運輸船隊的活動規律，也就無法抓住偷襲的機會。
偷襲中途島的難度也不小，唐帝國海軍在中途島上花了一年多的時間來加強這座島嶼地防禦。就算沒有拿到準確的情報，斯普魯恩斯都能夠想像得出來，這座島嶼幾乎就是一座堅固的堡壘。除了地面上密如牛毛般的高射炮羣之外，肯定還有大量的戰書飛機部署在島上，如果偷襲不成功，或者是首先被敵人的偵察機發現的話，那第五艦隊就將遭到滅頂之災。可仔細的考慮了一番之後，斯普魯恩斯認爲偷襲中途島並不是不可能完成的任務。
當時，唐帝國海軍航空兵已經開始向前線部署作戰飛機，並且承擔了部分空運，以及補充前線作戰飛機地任務。這些飛機都是從後方調遣過來的。就算唐帝國海軍的新式作戰飛機可以從威克島，或者是南鳥島轉場直飛中途島，也因爲中途島上的面積有限，機場的容納能力有限，從而不得不騰出更多的位置來，使機場上無法部署太多的作戰飛機，以及遠程偵察機。那麼，中途島的防禦能力就將降低很多，如果時機選擇正確的話，偷襲行動就很容易獲得成功。
在花了數個小時，反覆思考了數遍，解決了幾個關鍵問題之後，斯普魯恩斯做出了一項極爲大膽的決定：偷襲中途島！在做出了該決定之後，斯普魯恩斯就立即命令艦隊轉向，殺向中途島，趁唐帝國海軍的主力艦隊還在大海上尋找他的綜計的機會，出其不意的殺到中途島附近海域，給予敵人出其不意的致命打擊。
偷襲中途島最爲關鍵的就是時間上的選擇。從戰爭爆發以來，艦隊對島嶼基地的偷襲戰術實際上並沒有本質的轉變，其核心都是由艦載航空兵首先進入，炸掉島嶼上的機場，奪取制空權，然後全面轟炸，甚至安排炮擊編隊前去炮擊。這套戰術的關鍵就是要讓艦隊在不被敵人發現的情況下秘密靠近島嶼，進入艦載轟炸機的打擊半徑，並且迅速出動轟炸機，完成最爲重要的首輪轟炸行動。一般的情況下，爲了確保艦隊本身的安全，避免遭到敵人部署在島嶼上的岸基戰術航空兵的猛烈反擊，艦隊會選擇在夜間進入作戰海域，並且趕在天亮的時候就發動首輪突襲，不給敵人任何的反擊機會。可以說，在大戰期間，幾乎所有的針對島嶼基地的偷襲行動都是在這一模式下展開的。斯普魯恩斯也知道這種固定戰術帶來的風險。唐帝國海軍數次偷襲日本，美國的島嶼基地，而且幾乎都取得了成功。另外，唐帝國海軍的島嶼基地也數次遭到敵人的偷襲。特別是不久之前，尼華島，威克島才遭到了美軍的偷襲，唐帝國海軍不會不知道中途島的重要性，就更不會疏於防範。按照最簡單的思路，唐帝國海軍會重點加強夜間，特別是天亮前兩個小時對島嶼周圍海域，特別是容易遭到攻擊的最危險的方向上地搜索與偵察力度。確保敵艦隊無法隱蔽靠近島嶼。天亮前後，島嶼機場上的戰鬥機就會陸續起飛，執行防空巡邏任務。而要想第一輪偷襲成功，關鍵就得搶在敵人的戰鬥機升空之前投下炸彈。
反覆思索之後，斯普魯恩斯找到了兩個關鍵點，一是進入方向，二是轟炸時間。第五艦隊進入戰場的消息是無法保密的，中途島上的岸基航空兵會更加小心謹慎，說不定其防空戰鬥機在天亮前一個小時就會升空。另外，島上的遠程夜間偵察機。海上巡邏機都會集中起來使用。因此。必須要選擇一個合適的進入方向，以及合適的轟炸時間。
直接從東面進入是不可能的，這無疑是直接朝唐帝國岸基航空兵防範最嚴密地方向上撞了過去。從南面進入也不可能。這將使艦隊暴露在加德納島與萊桑島地岸基偵察機的眼皮子底下。相對而言，最好的進入方向是西面，可西面一直是美國潛艇活動地主要海域，唐帝國海軍在這邊有不少的反潛巡邏艦艇在活動，這些艦隊如果與第五艦隊遭遇的話，也會使第五艦隊的行蹤暴露。唯一的可能就是從中途島的北面進入。
在轟炸時機方面，斯普魯恩斯也沒有多餘的選擇，他必須要組織一次夜間轟炸。按照一般的情況，防空戰鬥機在天亮前半小時起飛就已經算是比較早的了。考慮到唐帝國海軍會加強對中途島的防禦，那麼唐帝國地岸基戰鬥機在五點鐘前起飛的可能性應該不大。就算在五點起飛，這些戰鬥機在天亮後還只有一個半小時的巡邏時間，然後就得返回機場補充燃料，飛行員也需要休息。而天亮後一個半小時是最爲危險的，因此把轟炸時間設爲凌晨五點是比較合理的，這就要求轟炸機在夜間進入，並且在夜間投彈！
最大的問題還是艦載航空兵的素質。對唐帝國海軍的艦載航空兵來講，夜間轟炸算不了什麼，自從第二特混艦隊在澳洲登陸戰役前進行了大規模的夜間轟炸之後。夜間轟炸能力成爲了帝國海軍飛行員地一項重要考覈標準，甚至連戰鬥機飛行員也開始掌握在夜間將炸彈準確投放下去的能力了。可是對美國海軍的飛行員來講，夜間轟炸絕對是高難度的能力要求。特別是對此時的第五艦隊艦載航空兵而言，在還有部分飛行員連晝間轟炸的技能都沒有完全掌握的情況下，要想讓轟炸機在夜間準確的摧毀地面上的重要目標，這幾乎是在賭運氣了。
在飛行員的素質無法滿足要求的情況下，斯普魯恩斯只有一個辦法，那就是用數量來彌補質量。第五艦隊有三支特混艦隊，九艘艦隊航母，超過了1000架的作戰飛機。“埃塞克斯”級航母一次最多可以放飛一半的艦載機，也就是說，斯普魯恩斯一次可以組織一半的戰機參加轟炸行動，500多架戰機同時出發，而中途島上只有一大一小兩座機場，集中兩批各500架的轟炸機羣來摧毀這兩座機場的難度應該不會很大。
到十三日下午，第51特混艦隊的參謀軍官才擬定好了詳細的轟炸計劃，三支特混艦隊的轟炸機各分兩批出發，第一批轟炸機要在五點前到達中途島上空，而第二批轟炸機將最少晚四十五分鐘，最遲在天亮後到達中途島上空，具體情況根據第一輪轟炸，以及艦隊航空勤務人員的準備速度決定。而這也能夠錯開兩批轟炸機的起飛與降落時間，在第二批轟炸機起飛之後，第一批轟炸機纔會返回艦隊。
也直到這個時候，斯普魯恩斯才把他的真實意圖告訴給了特納與米切爾，並且明確指出，這是尼米茲上將的命令。特納與米切爾沒有直接反對，說白了，他們也知道，在斯普魯恩斯做出決定之後，不管別的人多麼反對，斯普魯恩斯都不會輕易的改變自己的決定。
爲了避開唐帝國的偵察機，以及往返於前線與後方的唐帝國潛艇，第五艦隊在十三日到十五日之間多次轉向，多次改變航線。而要使艦隊繞到中途島的北面去，並且儘量節約燃料，這就需要精心的設計航線與航速。如果第五艦隊以直線向中途島航行的話，十四日就可以出動轟炸機轟炸中途島了，正因爲要控制速度，並且繞道航行，所以直到十五日傍晚，第五艦隊纔到達了中途島的東北部海域，並且再次轉向，朝着中途島殺奔而去。
在此之前幾個小時，談仁皓纔剛剛意識到了中途島可能遭到轟炸，並且發出了電報。留守中途島的指揮官在收到了電報之後已經開始組織防禦，並且把所有的偵察機都派了出去。原本集中囤積在島上的作戰物資也開始疏散轉移，在當天上午到達中途島的一支運輸船隊在下午的時候就離開了錨泊地，暫時到萊桑島“避難”去了。可問題是，中途島上囤積了成百萬噸的作戰物資，而且大部分的物資都是露天堆放的，要想迅速轉移幾乎不可能。
十六日凌晨，就在談仁皓考慮着該怎麼應付美軍第五艦隊的新威脅，中途島上的物資還沒有來得及完全轉移的時候，美軍的轟炸機陸續離開了航母，飛向了中途島……