路飛一夥離開空島後，在長鏈島與福克西海賊團玩“Davy Back Fight”，爲了救回自己夥伴（喬巴、羅賓），路飛拼死戰鬥，最終打敗了福克西，而重新搶回了喬巴和羅賓。之後，路飛等人與海軍大將青稚相遇，路飛爲了保全一夥人而選擇單挑，最終敗北，但“青雉”因爲阿拉巴斯坦事件和羅根的原因放過路飛一夥人。
“啊，海軍的大將好恐怖啊！我們完全不是對手啊！三兩下就被打敗了！”
烏索普戰戰兢兢的看着被凍住的海邊說道。
“那可是海軍的最強戰力啊！我們能夠活着已經是上天的眷顧了！”
娜美躺在草地上無力的說道。
“嗚嗚嗚，我還以爲死定了呢！”
喬巴抱着索隆的大腿哭泣着。
“……”
索隆抱着劍一言不發的看着大海發呆，山治也是默默的抽着煙，不知道在想什麼。
“不過曉組織好強啊！不弱於大將的世界政府高手都被他們擊敗了好幾個，就連四皇之一的凱多都是曉組織的人，古伊娜你知道麼？”
羅賓看着手中的新聞紙問道。
“我不知道，老師沒和我說過，實際上我對於曉瞭解的並不比你們多，老師將我送到阿拉巴斯坦之後，就沒再出現過，只是讓我跟着你們冒險，老師說等時間到了，我們會再次碰面的，他說我現在的實力還太弱了，不能摻和到曉的事情裡面。”
古伊娜有些情緒低落的說道。
“古伊娜已經很厲害了啊，就是面對海軍大將都能抗衡一段時間，這樣的實力都被你老師說弱，我們該怎麼辦啊！”
娜美痛苦的說道。
“我決定了！我要變的更強！強到比二爺爺都要強！比任何人都要強！”
突然路飛像是發了神經一樣的對着大海喊道，像是發泄之前慘敗的不爽。
路飛是天生的樂觀派，敗給青雉的鬱悶很快就被美食給打敗了，那狼吞虎嚥的樣子完全看不出剛剛被打擊的樣子。
之後路飛一行人來到水之都，打算利用空島得到的黃金翻修嚴重受損的梅麗號，卻得知梅麗號已經無法繼續航行。爲了保全船員的性命，路飛最終決定捨棄舊船，爲此引發了和烏索普之間的爭執。打敗烏索普後，路飛默默地向烏索普表示感謝，失去了梅麗號和烏索普的路飛終於忍不住流下淚來。
天有不測風雲人有旦夕禍福，在失去了烏索普和梅里號之後，羅賓也離開了，面對羅賓的離開真相，路飛當機立斷下令追回羅賓。路飛一夥來到政府要地“司法島”，不惜向世界政府宣戰，要求羅賓說“我要活下去”。在戰鬥中，爲了保護夥伴，路飛的潛力被激發，開發出了“二檔”和“三檔”，戰勝了布魯諾，在苦鬥的情形下戰勝了羅布·路奇。
而被判定已經無法航行的黃金梅麗號竟然神奇的出現在司法島的海域，將一行人給救走了，但是可惜在將衆人給救出來之後，黃金梅麗號的航行也到了結束的時候，再也承受不住滿身的傷痕，梅麗號在途中斷裂了。
“喂，梅麗號突然怎麼了！”
路飛驚慌的大喊道。
“什麼突然不突然的，這不是理所當然的嗎？”
山治咬着牙說道。
“哎？”
路飛不明所以。
“梅麗號已經被斷定不能再航行了！你們應該沒忘記吧！”
山治聲音低沉的說道。
“大叔！不好了！梅麗號出事了！對了，正好你們都是修船匠！求求你們了！快幫幫忙啊！它可是一直我們一直航行到現在的夥伴啊！剛剛還救了我們的命！”
路飛衝着艾斯巴古大喊道。
“那就讓它安息吧！我已經盡力了！”
阿斯巴古想起了在廢船島上看到的讓人難以置信的一幕。
“隆……隆……”
廢船島上傳來一陣敲打的聲音。
“那是什麼聲音？廢船島上還有人嗎？”
阿斯巴古拿着工具箱來到了廢船島。
“這不是草帽小子的船嗎？是被阿庫阿·拉古納沖壞了啊！真是太糟糕了！不對！是以前就破損的很厲害了！”
阿巴古檢查了一下梅麗號的狀況之後說道。
“我還想航行！我還想再航行一次！”
阿斯巴古突然聽到了一道聲音，他感受到了那道聲音包含的堅定，阿斯巴古猜測這應該是梅麗號的船精靈，他決定全力幫助這艘船再次出海，但是在忙完之後他又感覺這是白做，因爲他判定梅麗號已經無法航行了，但是就在他轉身離開的時候，他又聽到了一道聲音。
“謝謝！”
阿斯巴古震驚的轉過身子看到梅麗號衝向了大海，消失在大浪之中。
“我看到了奇蹟，一個超越了極限的船的奇蹟，雖然我做了很多年的修船匠，但我從沒有見過這麼了不起的海賊船!它不辱使命！”
阿斯巴古敬佩的看着已經無力航行的梅麗號說道。
“我知道了！”
路飛難有的情緒低落的和夥伴們離開了梅麗號，準備爲梅麗號送行。
“那麼，大家都準備好了嗎？”
路飛手裡拿着火把問道。
“嗯……”
草帽一夥難過的迴應道。
“梅麗，海底很黑，你會寂寞的，所以讓我們送你最後一程吧！烏索普不再，可能更好，他一定無法承受！”
路飛引燃了梅麗號，火勢很快蔓延到了整艘船。
“你載着我們航行了這麼久，謝謝你，梅麗號！”
路飛看着梅麗號說道。
突然從天上落下了點點光芒，一瞬間將草帽一夥的記憶拉回了和梅麗號一起的日子，所有人都悲傷不已，喬巴和娜美更是痛哭出聲。
“對不起！我還想帶着大家走得更遠，對不起，好想繼續跟你們一起冒險，但是，我……”
就在梅麗號開始沉入大海的時候，人們聽到了梅麗的聲音，頓時所有人的情緒都控制不住了。
“我們才應該說對不起！我不會掌舵，害你撞上了冰山！還弄破過船帆！索隆和山治都是傻瓜，老是搞破壞！雖然每次都是烏索普把你修好，但是技術卻很爛，要說對不起的是我們啊！”
路飛大聲哭喊道。
“但是，我很幸福！謝謝你們！一直對我這麼好！我真的很幸福！”
在最後的道謝聲中，搭載草帽一夥航行了一路的梅麗號沉入了大海，悲傷的情緒在草帽一夥中間蔓延着，梅麗號成爲了草帽團第一個退出了航行的夥伴！