葉清又在木葉森林待了五天，佐助還是沒有出現，葉清絞盡腦汁的回憶原著裡佐助潛入木葉擊殺志村團藏大概是什麼時候，按理說就是在佩恩侵入木葉之後發生的事。
大概就是綱手拯救木葉村民免於佩恩【神羅天徵】的傷害，釋放自己的禁術·陰封印，那是綱手額頭上出現菱形標記，微調節查克拉，達到瞬間治癒和加強攻擊，提高速度的效果，熟練運用者更可以靠百豪之印內查克拉的低輸出和微調節達到駐顏青春，提高身體機能，使身體機能保持在全盛狀態的效果。
綱手同時召喚出通靈獸——來自溼骨林的巨大蛞蝓，並把自身的所有查克拉給予蛞蝓，蛞蝓通過分裂到各處爲受傷的忍者以及村民進行治療。也正因爲她透過蛞蝓爲衆木葉傷者治療而耗用大量查克拉，故戰之後回覆老年狀態陷入昏迷。
在戰亂之後，鳴人也被卡卡西、大和等人帶離村子保護起來，而火之國則召開緊急會議，由於綱手查克拉使用過度昏迷不醒，火之國大名決定選舉新的火影，雖然有木葉智囊奈良鹿久推薦旗木卡卡西，但大名受團藏寫輪眼的控制而任命其爲六代目火影，團藏也開始實現他的野心，從火之國會議回來後便馬不停蹄的前往五影大會。
眼見團藏開完五影大會回到木葉，葉清忍不住就要自己出手斬殺團藏，然而當他截住團藏的時候，身後的空間突然扭曲，漸漸地一個穿着曉組織紅雲服飾、臉上帶着橘黃色螺紋面具的阿飛出現，看到葉清在此不由得大吃一驚，然而爲了心中計劃，他還是把佐助和香磷等CF成員從寫輪眼空間裡釋放出來。
這點卻是與原著不同，因爲水月和重吾也被阿飛帶了過來，而在原著中這兩個傢伙則是被鐵之國關押起來。在詢問了水月之後，葉清才曉得爲什麼佐助他們會來的那麼遲，原因竟然是被阿飛忽悠着去封印八尾奇拉比！畢竟曉組織現在已經沒剩下幾個人了，在長門死後，就只有絕和鬼鮫了。
鬼鮫原本在抓捕一尾我愛羅的時候，被卡卡西用神威拗斷了右肩膀，然而在他逃回曉組織基地的時候，被阿飛截取絕的右肩膀給鬼鮫換上了，而絕本身就是生機無限的木遁+陽屬性CKL，所以自己又重新長出右肩膀。
在CF成員與剩下的曉組織成員聯手封印八尾後，人柱力奇拉比已經是死的不能再死了，屍體被隨意的丟在一邊，“面具男”阿飛則對佐助宣稱自己其實就是“宇智波斑”，同時告訴了他家族與木葉曾經的恩怨，以及鼬的真實身份。
原來，宇智波鼬是木葉的雙重間諜，當年宇智波一族意圖謀反，爲了防止戰爭的爆發，宇智波鼬選擇親手滅掉自己的家族，換回木葉的和平。而且鼬其實一直都在暗中保護佐助，當年他以不殺佐助作爲同木葉高層談判的條件，並將佐助託付給三代目，因爲在鼬的心中，佐助比木葉更加重要。
佐助得知真相之後開始慢慢回憶起鼬的過往，漸漸相信了“面具男”所說的一切，憤怒與悲傷使得他的永恆萬花筒寫輪眼更加強大。他將CF成員召集起來，決定立刻前往木葉刺殺逼死鼬的幕後黑手──志村團藏等三位木葉高層，以及摧毀對家族實行滅族政策的木葉。
佐助率領的CF成員在“面具男”阿飛的幫助下準備向木葉進攻，不過途中被絕帶回消息告知木葉已被佩恩徹底摧毀，於是阿飛立即轉變目標，帶着佐助等人潛入五影大會，準備刺殺代理火影的團藏！
在會場，佐助見到了團藏，然而卻被其他風、雷、土、水四影纏上，幾人亂戰一通，團藏卻趁機逃跑了，佐助因爲瞳力大增且實力也比原著強很多，憑藉完全體須佐能乎和四影打的不分上下，但佐助見到團藏逃跑，無心戀戰，便使用天照阻攔四影，自己則帶着水月等CF成員繼續追擊團藏。
接着阿飛出現擋住風、雷、土、水四影，並說出了“月之眼計劃”，威脅其交出九尾的人柱力鳴人，四影在阿飛的逼迫下仍未改變決心，於是阿飛宣佈第四次忍界大戰開始了。
繼而阿飛追上佐助四人，用寫輪眼把他們瞬間出現在逃離會場的團藏面前，佐助見到團藏就忍不住的衝了過去，與團藏遙遙對峙，佐助赫然發現團藏竟然擁有寫輪眼，而且還不少，一條右手臂上整整十個寫輪眼。
出離憤怒的佐助瞬間發動須佐能乎抓住團藏並質問團藏寫輪眼的來源以及關於鼬的真相，但團藏只是輕蔑的看着佐助，說道：“沒想到鼬那個傢伙也保不住秘密啊，真是個木葉的叛徒！”
佐助聽到團藏褻du鼬，不由得怒火爆發，催動須佐能乎將團藏捏碎，但此時團藏卻又再次出現在佐助身後，不過感知強大的葉清卻是看到團藏手臂上的寫輪眼閉上了一隻，葉清知道團藏那種殺不死的能力其實就是連宇智波一族都將其列爲禁術的伊邪那岐。想必香磷也已經察覺，只不過不知道這種能力罷了！
伊邪那岐是一個能將自己不利或者死亡的局勢改寫的一種作用於自身的終極幻術！然而葉清卻對此不以爲然，因爲整來整去還不就是憑藉大蛇丸改造的身體能發動十次禁術伊邪那岐，而在戰鬥開始後，佐助就讓水月、重吾帶着香磷躲遠些，因爲他要親手斬殺團藏。
葉清繼續看下去，佐助、團藏兩人繼續對決。佐助不斷使用天照、須佐能乎等招數“殺死”團藏，但團藏仍能不斷“復活”，而團藏更抓住機會使用咒印將佐助定住，然而佐助在兩秒鐘後就突破束縛，一劍將團藏刺穿。
然而團藏又復活了，又重新和佐助撕b，葉清實在看不下去了，兩個傢伙打來打去就是用寫輪眼的對決，佐助還好，永恆萬花筒毫無禁忌，團藏卻慘了，手臂上十個寫輪眼已然用掉了九個。
在這樣打下去已經毫無意義，葉清決定插手戰鬥，因爲照眼下的局勢發展下去，等團藏消耗完寫輪眼，就會發動最終的裡四象封印將阿飛和佐助一同封印進體內，雖然原著中並沒有成功，但到那個時候自己可就回收不了宇智波止水的別天神寫輪眼了！
於是在團藏第十次被佐助“殺死”，團藏第十次重新出現的剎那，葉清已然開啓仙人模式並發動手裡兩把長刀：“貫穿一切吧！神殺槍-舞踏連刃！”
兩把長刀涌現刀芒，“霍”的閃過峽谷，水月、重吾、香磷等人根本沒看清刀刃所在，而阿飛和佐助也只是憑藉寫輪眼看出了一點點刀芒的軌跡，而在刀光過後，衆人訝然看到原本殺不死的團藏已經人首異處，團藏好大一個狗頭沖天而起，葉清接過團藏的狗頭，臉上露出了微笑，終於集齊了呢，別天神寫輪眼！
繼而葉清忽然瞧了瞧木葉方向，感知到原來第七班的幾個朝這裡過來了，想來是察覺到了這裡的sao動，不過自己可沒工夫和他們撕B，還是把這裡的局面還給佐助吧，想完葉清便發動飛雷神離開了這裡，徒留佐助與水月等人面面相覷，阿飛卻是盯着葉清消失的地方，眼裡充滿了異樣的光采.....