真嗣感覺自己很久都沒睡過這麼舒服的一覺了，清爽怡人，微風陣陣··風？
經歷了大半年戰鬥的少年也稍微有了一些警惕性，就在他起身的瞬間，他聽到了一個熟悉的聲音
“你醒了？醒了就起來吧”
“長門啊~”，真嗣立刻就放下了心，然後睜眼所見，“···”
這裡是一種生物的體內，能清晰的看到一些怪異的生物結構，甚至剛纔吹到身上的涼風都是這生物的體內吹出來的循環風。另一邊長門躺在一個躺椅上，面前有一個生物組織做成的電腦，長門在上面··不知道幹什麼
EVA世界並沒有正常科技世界裡的電子遊戲，世界都要毀滅了，誰還有工夫開發遊戲，就算你開發出來遊戲，也就是在某些地方內部流傳，比如NERV
“這是什麼？長門你把我帶到什麼地方了？”
“你很清楚不是嗎？”
“我··”，真嗣當然有自己的猜想，“這裡是··第四使徒的內部？”
“正是，真嗣你猜對了，所以我要給你一些獎勵”
真嗣被嚇了一跳，“什··什麼獎勵？”
“比如告訴你爲什麼把你帶到這裡來”
真嗣十分無語，他發現長門變得有些無厘頭，這樣真嗣感覺很難受，他記憶裡的長門不是這樣的
“你到底··”
“這就是我的本來性格，我在美里家裡，不··在更久之前，我都是裝的，演戲而已，懂嗎？”
“騙人的吧··”
“真的！”
真嗣本能的往後爬，想要遠離長門，“那你··到底是什麼？”
“我啊，我是上個紀元的人類”
“上個紀元的人類！？”
“對，就是寫下死海文書的那羣人類，上個紀元的存在，本紀元人類的前輩”，長門說着在真嗣面前升起一臺生物電腦，“看，這就是我們那個文明裡記載的東西，翻譯過來叫做電子遊戲”
真嗣猶猶豫豫的點了上去，畫面轉動讓真嗣感覺很好奇，古樸的文字真嗣並不認識，於是不知道該做什麼，長門打了個響指，字體變成了日文
“黑··魂？”
“是的，點開始看看”
真嗣點了上去，開始了魂三的開場動畫，真嗣並沒有看過這麼帥氣的東西，沉迷了進去，開場動畫結束之後，真嗣也清醒了過來
少年沒玩過遊戲自然不會有遊戲方面的愛好，所以詢問長門：“你就是··帶我來看這個的？現在幾點了？我要去上學”
“放心吧，上學方面已經有人替你去了，你看”
長門再次打了一個響指，出現了另一個屏幕，上面是學校裡的一切，裡面也有一個真嗣，和劍介、東治兩個傻笑，被明日香罵了之後在撓撓頭，惟妙惟肖
這讓真嗣陷入了巨大的恐慌之中，他發現自己的存在沒了，於是就想逃走，大聲的叫喊着。但這裡是十尾的內部，他能跑哪去，最後還是停了下來
“爲什麼這麼害怕？”
“你··你要對我做什麼！？”
“哎~，你這個孩子就是不冷靜，你要想想，我都把你帶到這裡了，如果我真的想對你做什麼，何必還讓你現在好好的呢？你又反抗不了”
“我··”，真嗣還是害怕，但··有點冷靜了
“哈哈~，果然還是個孩子啊”
“我··”，真嗣沒有什麼反駁的地方，不過生氣也能增長膽氣，真嗣問道：“你到底要對我做什麼？爲什麼把我帶到這裡？”
“準備告訴你一些事情，同時我準備和初號機談談，你睡醒的太晚了，那邊都出發了，那我就長話短說一下”
長門非常的言簡意賅，“初號機是你的媽媽”
“？？？”
“故事要從很久以前開始說起，比如說··你四歲”，長門把生物電腦挪到真嗣面前，上面分屏顯示兩分文件，實際是一份文件兩種語言，“你可以看看，這是EVA的開發試驗記錄，美國NERV第二支部的內部信息，德國的我也有”
“你先慢慢看，有不懂的問我就好”
······
和明日香她們在一起的真嗣來到了NERV總部，今天是禮拜二，上完兩節課之後就要來總部進行同步率測試。三人很快換上作戰服，各自進入插入栓，開始和機體進行同步
初號機的同步率有了一次突然的起伏，律子這邊看了一眼，沒有太過於在意，剛開始同步總會有些問題，然而在一號及內部，長門已經見到了碇唯
“我兒子在哪！？”
長門伸出手，“靈魂的聯動我們倆還做不到，所以你需要接觸我一下”
碇唯一點都不在乎，觸碰了長門的手，碇唯就看到了十尾內部的真嗣，真嗣正在非常專注的看着什麼
“你對我兒子做了什麼？”
“我在告訴他真相”
“爲什麼！？”
“你應該明白你丈夫在做什麼吧？”
“我知道，所以呢？”
“你和莉莉絲的靈魂溝通過嗎？”
“有過一些，但不多，溝通太多莉莉絲會吞噬我”
長門表示理解，莉莉絲的強度不是一般人能做到的，碇唯也是厲害。其實對於初號機來說，真嗣的存在只是電池和開關，真嗣上機纔會有能量，並且能讓碇唯操控初號機
“所以你準備藉着你丈夫的計劃，讓你兒子成神？也不算是神，就是成爲莉莉絲這種存在？”
“我··我沒有”
“猶豫了呢~，你可真敢想，你這麼做，在乎過真嗣嗎？”
“這跟你有什麼關係？”
長門撇撇嘴，“關係說大也大，說不大也不大。故事很長，你是這個世界第二個聽這個故事的人”
長門把系統的存在和自己的目的告訴了碇唯，碇唯雖然在存在上不如渚薰，但是在腦洞和意志上，這位比渚薰都要厲害。靈魂之間的交流非常快，長門講完一切也在過了正常測試時間的一半
“你要把真嗣帶走嗎？”
“如果你不願意的話我可以不帶走他，但是··如果我和老碇說了這些，你覺得你們夫妻倆能留下嗎？我雖然有復活一個人的能力，但··在這個世界裡不行”
“那你就別告訴他！”，碇唯咬着牙說道，她爲了兒子也是豁出去了
“這沒問題”，長門聳聳肩，“但是··你覺得真嗣現在的生活怎麼樣？而且將來我把初號機帶走，你不在··老碇就能看得開了？就能照顧好你兒子了？”
“而且造成真嗣現在這個性格，這個爲人處世的能力，你們··夫妻倆一丘之貉吧？”
“我··”，碇唯那是恨鐵不成鋼，“我也不知道源堂會變成這樣，而且當初實驗事故的時候，我根本不能選擇離開！EVA需要靈魂，我即便強行脫離，我也不會有好結果的！”
碇唯看的很清楚，所以她才留了下來，沒有成爲明日香媽媽那樣
兩個媽媽各有各自的偉大，事實上兩人作出不同的選擇導致不同的悲劇的原因，是因爲兩人掌握的信息量不同。碇唯知道很多秘密，碇家和SEELE有很深的聯繫，所以她決定留在初號機裡
香香媽媽沒有這些東西，她只是一個普通的研究員。她雖然是因爲一些小嫉妒，嫉妒前夫有了孩子就不要她，就試管嬰兒製造了明日香。但她對明日香也是真的愛，從她出來之後抱着那個娃娃就能說明一切，所以她是害怕不能再陪伴香香，才死命掙扎着脫離了EVA
但是EVA需要靈魂，你一個好好的大活人進到裡面去，想要完好無缺的跑出去那是不可能的，所以香香媽媽丟了半個靈魂在裡面
“所以我覺得解決你們家的問題的唯一辦法，也就是我了。我帶着你們兩口子，或者一家三口，離開這個世界，到底是兩個人還是三個人，則是你們選擇”
“給我一些時間”
“沒問題，現在才十二號使徒，還有四五個呢，那麼··期待下次再見”
······
回到十尾內部，真嗣被資料裡的東西給嚇到了，當然很多東西他看不懂，但看得懂的就已經足夠嚇人了
“這兩次事故··”
“嗯~，一次是你的媽媽，一次是香香的媽媽”
“難道說？”，真嗣已經完全懵逼
長門笑着點點頭，“我已經告訴你了，那就是真相，你媽媽的靈魂在初號機內部，香香媽媽的半個靈魂在二號機內部，順帶一提，我把這個已經告訴香香了”
“什麼？這··”，真嗣想到了最近明日香每次在訓練之後都會在二號機前說些什麼，這麼一看，就是長門做的了
“你還不明白嗎？這是你母親對你的愛護，你真的以爲，你想想當初面對第三使徒水天使的時候，再想想上次的第十二使徒夜天使，還不懂嗎？憑什麼只有你？”
“我已經和你母親見過一面了，就在剛纔”
“媽媽？她··她··”
“她很關心你的生活，對你也很有歉意，因爲沒有照顧好你”
真嗣瞬間淚崩，“沒有的事，媽媽才··我都不知道的，我··”
“你生在一個科學家的家庭裡，是你的幸運也是你的不行，你知道諾貝爾嗎？”
“那個··第二次衝擊前建立科學獎的科學家嗎？”
“看，這是諾貝爾的一生，他炸死了他的弟弟。這位是居里夫人，她和他的丈夫，還有他們的孩子，都是科學家，他們全家都死於放射性物質，而且這種影響會遺傳到他們的後代體內，畸形和先天病”
“因爲科學研究死亡或者失蹤的人數不勝數，在上個世紀南極考察的南極考察隊每年都要死幾個，還有病毒、醫藥方面的研究，化學、生物，作爲一個科學家的家人，突然失去某位科學家，並不是不可預知的”
“但是你們家比較特殊，你的父親不是個好的父親，他把你變成了這個樣子。我並不期望能改變你太多，我只是要告訴你，你並不是唯一的，而且如果你想改變現在的樣子，就要自己邁出腳步”
“當然，你也可以選擇享受母親的關愛，畢竟那是她應該做的，她十年沒有關愛過你，幫你也是應該的，照顧你也是應該的”
“不是的！”，真嗣的想法很簡單，母親沒有錯，她的失蹤都是爲了自己，“我沒有這麼想過”
然而長門不爲所動，“你需要否定的不是我，好好想想你對於這些事情的看法，如果你需要更多的資料，找我就好。但是如果你回去之後只會躲在牀上聽你的隨身聽，那麼··我會放棄你。你的確是個孩子，你也很悲慘，但如果你就願意這樣悲慘，只等着別人來救你而不去自救，這個時候你要記住，別人不是你爸，也不是你媽，不欠你什麼”