秦峰告訴華佗，鼠疫是鼠疫桿菌引起的，所以治療的藥物，就要去抗菌藥物中去找。
華佗茫然，道：“主公，屬下能力有限，不知那些是抗菌的藥物。”
不能怪華佗，漢末這個時代，對於病毒和細菌真的是門外漢。他們都不懂這個，自然不知道那些是抗病毒中藥，那些是抗菌的中藥。
其實秦峰最初也不懂，但他畢竟有上一世的經歷。那時候他老了，捨不得他的老婆孩子和他的國家，他怕死，就要養生保健，記住了許多中藥。後來又在後世帶了一陣，就能相互印證。
秦峰迴憶中道：“我來告訴你，金銀花、連翹、大青葉、板藍根、青黛、馬尾連、紫花地丁、蒲公英、穿心蓮、四季青、黃柏、黃連、黃芩、馬齒莧、白頭翁、大蒜、魚腥草、野菊花、苦蔘、香大黃、馬蹄黃、川軍、將軍……。”
秦峰一口氣說了近百種後世最有效的抗菌中藥。
華佗大喜過望，須知中藥數千種之多，若不是秦峰告訴他，他根本就不可能準確的找到。
軍師們看到華佗露喜，心裡多少好了起來。
龐統摸了摸朝天鼻，“以前總感到書本里描述孔孟老莊聖人們神乎其神，無所不知無所不曉，還有些懷疑。吾主，真聖主也。”
“孺子不可教，不知天高地厚，若不是聖人佈道，你知道你是人嗎？”老賈詡從旁教訓道。
龐統一瞪眼，“老傢伙，本軍師若是不知道，你也不知道。”
“哎呦~！”老賈詡氣的鬍子哆嗦。
若非秦峰在這裡，恐怕是又要打起來了。
秦峰就教導華佗，“這些藥，都是療效顯著的抗菌藥，要在這些藥物中辯論，論證，尋找新的藥方。可建立試驗機制。”
“主公，何爲試驗機制？”華佗急忙問道。
秦峰就道：“可招募試驗藥劑的志願者，嘗試各種新的治療。病人加以編號，藥方加以編號相對應。哪一個編號的病人好轉，就說明這個編號的藥方有作用，可針對性的更加深入研究。”
華佗大喜，拜道：“主公聖明，我對主公的敬仰猶如滔滔江水連綿不絕……。”老華佗一激動，就感到必須要拍馬屁，不讓根本無法表達他此刻的心情，可他不會拍，好像從哪裡聽到過一句，說了一半記不得了。
“又猶如黃河氾濫一發不可收拾。”老賈詡跟了一句。
“對對。”華佗急忙道。
這馬屁拍的硬是要得，大廳裡終於有了一絲笑意，但很快就沒有了。
秦峰就詔令軍機處，在軍中挑選志願者，配合華佗的研究治療。
這時候天已經黑了，但對於秦峰來說，此刻已經沒有白天和黑夜的區別，他再次強調了隔離制度，衛生制度的重要性。就令軍師們還有華佗，繼續展開工作。
軍師們出去後，龐統就掐住了老賈詡的白鬍子，老賈詡反手就插龐統的朝天鼻。軍師們紛紛勸架，要以大事爲重，這才作罷。要說二人爲何‘成仇’，據傳聞龐統科舉時候的卷子是老賈詡判的，而龐統一次名落孫山，一次纔是二甲頭名。其實卷頭都是封着得，賈詡根本就不知道那張是龐統的卷子。
秦峰返回了後宅，爲了保護孩子們的安全，他只能隔着房門和孩子們說話，他在每一位夫人和孩子們那裡逗留，一直到深夜。
“不要害怕，快去睡覺吧，爸爸會一直在門外守着。”秦峰說着善意的謊言，他雖然無法一直在門外，但他的確一直在守護着他的家。
“爸爸，加油，你一定能大敗鼠疫的。就像打敗那些羅馬鬼怪一樣！”
秦峰十分擔心他的老婆孩子，但凡有一個人若是出事，他恐怕也活不成了。好在至今，沒有一位夫人和孩子生病。他十分感謝老天爺照顧，但他又在從科學角度去考慮。
沒準他老秦家有免疫力，他的孩子們從他這裡繼承了免疫系統，沒事。而他的夫人們，那也是經常一體化的，沒準那啥也能夠產生抗體。
古代的防疫條件根本無法和後世相提並論，他和他的夫人們都接觸過月英，卻是沒事。這更加堅定了他老秦家免疫，疾病中總有免疫的人羣，這次落在了他的身上，實在是幸運。
到第二天天亮，秦峰就睡了一個時辰。
時間匆匆過，日復一日，距離秦峰實行隔離制度，已經過去了半個月。北方大地上，依舊一片混亂。鼠疫，在不斷奪走人們的性命。值得慶幸的是，人們團結在了一起，對抗鼠疫。各地發生了許多舍小家顧大家，捨生忘死的事情。當然，也發生了許多自私自利，反而幫助了鼠疫的事情，這些人，被黑衣衛秘密殘酷的鎮壓了。
公元197年五月十五日，大朝會。
新宮的建設已經停滯，漢獻帝只能無限期的在小宮殿里居住。
這時候的漢獻帝，恐怕是真心的老老實實坐在皇位上，靜聽着秦峰說話。百官們毛呆呆的，他們充滿了恐懼，其實都不願意來朝會，生恐聚集被傳染。
於是乎，上至漢獻帝，下至小官員，全部帶着口罩，帶着手套。
秦峰反而沒有帶口罩和手套，他早跟月英接觸過了，若是得病也早就得了。漢獻帝和百官敬畏的看着他。
朝會上，秦峰再一次強調了隔離制度、衛生制度的嚴格執行。漢獻帝小雞吃米的點頭，恐怕這是他唯一一次真心希望秦峰全權負責，在這種天塌地陷般的形勢下，整個朝廷也處在恐慌中，根本不敢面對，好在有秦峰。
“相較於十天前，每日新增病例開始減少，這表明隔離制度開始體現效果，峰值因此過去，鼠疫已經可以有效控制了。”
衆人大喜。太常王朗疾步而出，道：“想鼠疫初期，衆人束手無策，是丞相力挽狂瀾，救國家社稷於水火之中。丞相的大恩大德，吾等永感五內。”說完，王朗納頭便拜。
於是百官拜倒在地，“丞相的大恩大德，吾等永感五內。”
官員中，就馬日磾和董承還站着。
國舅董承十分擔憂，小聲對馬日磾道：“馬大人，秦峰在這次瘟疫中反而更加積累了威望，這人手段之高，實乃自古以來奸賊之首，當年的王莽都無法和其相提並論。不能任由事情這樣下去，在這樣下去，秦子進一定會逼陛下讓位的。”
“那怎麼辦？秦峰在朝廷和民間的威望極高，跟董卓他們完全不同。”馬日磾毫無辦法。
“我有一法，可消滅秦峰。”董承忽有所得，神情變化道。
“是何辦法？”馬日磾問道。
“就用鼠疫之事……。”
“噤聲，下了朝詳談。”馬日磾道。(。)