9月28日，孫百里乘坐專機前往臺灣，準備以中國戰區司令長官的身份會晤中太平洋戰區司令兼太平洋艦隊司令尼米茲上將，商討進攻日本本土的作戰計劃，並確定戰役的指揮權
上午十點整，孫百里在臺北市內的省政府辦公室內接見了剛剛從基隆港趕來的尼米茲，隨即進行了一場卓有成效的會談
尼米茲的年齡在五十歲上下，中等身材，身穿潔白的海軍上將制服，寬闊的帽沿下露出濃密的白髮，配上略微有些消瘦的臉型和深邃的藍眼睛，看起來像一個在華爾街出沒的銀行家
寒暄之後，孫百里開門見山地說道：“尼米茲將軍，我這次來臺灣主要是爲了兩件事情：第一，制定進攻日本本土的戰略原則；第二，確定戰役的指揮權歸屬你作爲美國太平洋艦隊的司令官，已經在夏威夷、澳洲、幾內亞等地和日本陸海軍戰鬥了兩年多的時間，對日軍的虛實應該瞭如指掌，能否先談談自己的看法？”
尼米茲點了點頭，不徐不疾地說道：“日本聯合艦隊先後在兩次海戰中敗北，接着又落入了中國空軍的圈套之中，損失慘重，已經沒有能力阻止盟軍對其本土的進攻，最多也就是起到些騷擾的作用，改變不了戰爭的進程和結局，所以基本可以不要考慮但是，根據盟軍在南太平洋島嶼和澳洲大陸上與日本陸軍的作戰經驗來看，其戰鬥力相當強，官兵全都悍不畏死，現在又是爲了保衛自己的家園在戰鬥，肯定會加瘋狂，所以要重點考慮”
說到這裡，尼米茲看了看孫百里，笑着說道：“中國軍隊已經和日本陸軍打了七年的仗，應該比我們熟悉他們的情況”
孫百里也笑着說道：“日本陸軍的精銳部隊不是深陷中國戰場，就是被調到南太平洋的島嶼上，所以本土的守備部隊反而是最弱的，不能與美軍在南太平洋上遇到的軍隊相提並論另外，根據我們的經驗，日本陸軍的野戰能力並不是很強，但是在防禦戰略要點，有堅固工事爲依託的時候，表現出來的戰鬥力可能會成倍的增加，盟軍進攻日本本土，肯定會面對無數這樣堅固的堡壘，必須要有完全的準備”
尼米茲對孫百里的意見深表贊同，他說道：“日本陸軍就像老鼠一樣，喜歡在地底、甚至山體的內部挖洞，以此來應付炮擊和轟炸，這些我們已經從太平洋戰場上得到了清楚的認識，現在，海軍陸戰隊剛剛配備了噴火坦克，專門來對付日軍的地堡和坑道，這樣一來，工事能起到的作用就非常有限了”
“另外，爲了減少部隊在進攻的損失，有必要在臺灣和福建兩地模擬修築了日軍防禦工事，然後由武器專家和作戰部隊指揮官進行實地研究，找出最直接有效的辦法來”
孫百里對尼米茲高的戰術素養深爲佩服，因此加堅定了讓他來‘背黑鍋’的決心，於是有針對性地提出了第二問題：“根據我國空軍偵察機和轟炸機拍攝回來的航空照片，日本軍隊和國民正在國內的各個重要城市和交通線附近構築工事，進行決戰前的準備工作，而已經動員起來的軍隊員額保守的估計也在兩百萬左右，如果由將軍來指揮進攻的話，將如何選擇進行呢？”
尼米茲不假思索地回答道：“我認爲盟軍應該採取步步爲營的策略向東京逼近首先攻克沖繩島，接着佔領九州，最後纔是東京所在地的本州島”
孫百里故意問道：“爲什麼不在佔領沖繩之後，直接進攻東京呢？這裡既是日本的首都，又是天皇皇宮的所在地，佔領這裡對日本軍隊和國民的心理將造成毀滅性的打擊，從而縮短戰爭的進程”
尼米茲解釋道：“越過九州島直接攻擊東京的話，艦隊的將暴露在敵軍岸基飛機的攻擊範圍內，日本航空兵雖然損失慘重，但是如果採用自殺式攻擊的話，還是會給艦隊帶來巨大的威脅的另外，登陸部隊的補給也很難維持”
孫百里又問道：“那你認爲什麼時間開始最好？”
尼米茲馬上回答道：“等到中國軍隊收復了華東和徐州之後，就可以開始了——從中國沿海機場起飛的中型轟炸機也能攻擊日本本土，整個黃海將處於空軍的嚴密監視下，海上補給線的安全就有了保障”
孫百里點了點頭，問道：“整個戰役需要出動多少地面部隊？”
尼米茲的表情變得嚴峻起來，沉聲說道：“這就很難說了日本軍隊的頑強是有目共睹的，而日本政府和天皇又迷夢未醒，妄圖堅持到歐洲戰爭結束，因此主動投降的可能性微乎其微，所以我估計至少也要兩百萬以上的地面部隊才能保證獲得最終的勝利”
孫百里冷笑着說道：“現在的俄羅斯草原已經是深秋時節，秋雨連綿，暴漲的河水和泥濘的道路使德軍不得不放慢了前進的步伐，而冬季馬上又要來到，要想徹底解決蘇軍，肯定要等到來年夏天，可是日本人能堅持到那個時候嗎？”
尼米茲笑了笑，說道：“還有一種情況必須要考慮——如果日本政府和天皇逃跑到中國東北繼續頑抗，或者天皇不幸死在戰火中的話，不但軍隊的投入會持續增加，戰爭的結束也會遙遙無期”
“是啊”孫百里深有感觸地說道：“日本除了天皇這個精神領袖之外，沒有一個政治傢俱有足夠的威信來領導矛盾重重的海軍部和陸軍部，如果真的出現這種情況的話，只有將日本軍隊全部殲滅才能結束戰爭”
孫百里看尼米茲對整個戰役的戰略和戰術都把握非常準確，終於放了心，直截了當地提出了指揮權的問題，他說道：“尼米茲將軍，我想由你來指揮進攻日本的戰役，你看怎麼樣？”
尼米茲搖了搖頭，說道：“離開美國之前，羅斯福總統親自告訴我，要把整個艦隊的陸戰隊的指揮權交給總統先生另外，地面部隊和空軍都是以中國軍隊爲主，又是從中國發起進攻，理所應當由中國的將領來指揮戰役”
孫百里急忙說道：“將軍，你就不要推託了攻擊日本本土的行動，不但要跨越數百公里的海面，而且涉及空軍、海軍和陸軍之間的協同，是個非常龐大的計劃，沒有經驗的話，是很難勝任的你也知道，中國海軍的實力本來就非常弱，又在對抗日本海軍的戰鬥中全軍覆沒，所以我的將軍當中沒有一個人有兩棲作戰的經驗，所以指揮官的位置非你莫屬”
說到這裡，孫百里不由自主想起了在收復臺灣戰鬥中犧牲的將士，沉聲說道：“當初我軍在佔據了壓倒性優勢的情況下發起臺灣戰役，竟然還傷亡了好幾萬人，由此可見，沒有經驗是不行的”
尼米茲聽了孫百里的這番話，也就不再推辭了，孫百里隨即以中國戰區司令長官的身份任命他爲日本本土作戰的總司令
這時候，尼米茲忽然想起了一個非常重要的問題：“總統先生，中國既然沒有強大的海軍，那麼造船工業應該也不是很發達，可是該如何對在戰鬥中受損的戰艦進行維修呢？中國和美國之間不但隔着浩瀚的太平洋，而且沿途還有很多島嶼在日本的控制下，送回國維修是不可能的”
孫百里眼睛一亮，心頭也是一陣狂喜，急忙說道：“福州造船廠曾經造過排水量在四千噸左右的戰艦，具有一定的經驗和設備，如果美國政府能夠在近期提供些設備和技術人員的話，還是能進行簡單的維修工作的”維修船隻可以藉機觀察戰艦的結構，從而提高自己的造船技術，絕對是一本萬利的生意，說不定連航母的技術都能學到手
尼米茲沒有多想就非常爽快地答應下來，使孫百里着實高興了一會
安排完事情之後，孫百里立即啓程返回重慶，尼米茲將軍則立刻把自己的指揮部從戰列艦上搬到臺北，然後在中國統帥部派來的幾十名參謀人員的協助下，進行緊張的準備工作
9月30日，徐州守軍棄城而逃，猶太軍團在佔領了整個市區之後，立即兵分兩路，一路向東急進，將徐州至連雲港之間的日軍守備部隊殲滅，以裝甲部隊爲主力的南路軍則沿着津浦路向南推進，把江淮之間的日軍向長江下游趕去此時的日軍守備部隊因爲忙於撤退，基本上沒有進行像樣的抵抗就放棄了陣地，使猶太軍團一路高歌猛進，很快就推進到南京中山碼頭對面的浦口，至此，整個黃河與長江之間的廣大地區全部光復
0月5日，國軍突入上海市區，經過一天一夜的激烈戰鬥，將斷後的一萬五千名日軍殲滅，收復了中國最大的城市，中國最富庶的地區也宣告光復與此同時，中國空軍出動了兩百架轟炸機，把正在海面上航行的日本最後一批漁船悉數擊沉，四千多名日軍連同隨身攜帶的武器彈藥全部葬身大海