在確認了任務已經完成後，丁宇他們又得開始面對新一輪的挑戰了。在桃源中心木屋中，10個人坐在會議室一起探討後面的路程該如何進行？該如何調整？又該如何安排一切。丁宇也讓小智吸收世援組織的所有資料，以便利後面的快速查詢，同時也調集了所有的相關資料，連同雄獅小隊的資料，神話傳說的資料...等等，他們首先要做的是整理一下桃源的資源，然後必須彙集資金，還得找到可獲利的途徑，建立桃源專屬的組織團隊。
丁宇讓小智把桃源升級到8級，升級成功後。桃源的變化極大，系統列示出增加與變化的部分，丁宇他們仔細一看，上面寫著：『系統升級到8級後，所有生物智腦將由學習階段進入歷練階段，主智腦正式成爲系統一階掌控者，其他副智腦的掌控範圍必須由主智腦指定，指定完成後方可進行系統8級運作。8級主系統中各副系統均有不同變化，請成員用心瞭解！
控制系統（中心木屋）已達到3萬平方米（相當於45畝），開啓星空對應面積，一樣爲3萬平方米，目前尚無任何星系，系統贈送傳送裝置一套，可定點傳送一處，每次一人，定點開放1處，可以隨時傳送到該定點。
智能系統開放智能機械人的生產，目前只可以生產工程機械人、工作機械人與武裝護衛機械人，總數量限制各爲10臺上限，工程機械人可以協助各類工事的建造，武裝護衛機械人可以協助各類攻擊護衛行動，工作機械人可以執行各類指定工作，工程機械人將由工程輔智腦（小維）統轄，武裝護衛機械人由武裝輔智腦（金剛）統轄，工作機械人將由生活輔智腦（夥計）統轄。強化系統輔智腦（小智）即時整合能力，可以協助主智腦授權下的所有自主工作，處理桃源中的一切事務。開放即時階段任務系統，將由系統輔智腦隨時發佈，完成後可以得到相應獎勵。
生態系統目前面積3萬平方米，各區域可指定開發，開放地下對應面積，一樣爲3萬平方米，目前尚無任何生物，系統贈送各類礦石資源，可由生物智腦指定開採，同時開採數量爲一種可輪替，開採過程所需將由系統處理，無須生物智腦羣親自動手，種植、畜牧、養殖..等，一樣由系統直接處理，智腦羣可在倉庫中直接取用或交易。
輔導系統開放原生態（對應太古時期知識）相關科目提供學習，開放位面交易功能，目前能交易位面爲地球，交易品只能爲桃源產出品，以能量購置物資不能交易，交易價格由生物智腦自訂，運送方式由生物智能自行安排，交易貨幣爲生物智能現存生活環境貨幣，交易量與種類不設限，但可保密使購買方無從追蹤來源。
倉儲系統加強活物生命維持能力，開放組織權力，生物智腦羣可以自主決定吸收參與桃源計畫成員，但分核心、內環、外環與協約四大類，核心成員皆爲生物副智腦，受系統最高保密條款約束。內環人員要求不可瞭解桃源有關一切事物，只能執行指定任務，必須植入芯片以確保安全度，違背者毀滅。外環人員不可與桃源有任何接觸，只爲協助內環人員處理一切事物，必須進行DNA確認，以確保安全度，違背者毀滅，協約人員只爲協助外環人員進行各項工作，不得進入主要基地，不需進行任何確認工作，可短期、中期、長期或是終生協約，由生物智腦羣依需求判定。
資料系統功能強化，可在不破壞與泄密的原則下進行各項侵入網絡主機行動，但不得運用於現存環境中的非法行爲，不可破壞生物與生態安全，可以進行生物智腦羣的資料更改，獲取各類特種許可，但不可進行任何侵犯任何組織主權，可以打擊非法。
神經系統已提升到4倍時間逆差，生物智腦各項指數已提升至優良級別，超越現存環境生物的平均指標20％，目前評分爲80分。能量系統取消儲備上限限制，開啓能量轉換功能，生物智腦羣可以轉換爲現存環境中所需的各種不同能量，含生物能量。
傳送系統功能強化，開放生命體定點傳送功能，可以隨時傳送到該定點，每次傳送人數與傳送地點數，由控制系統主導。
維護系統功能強化，開放能量回收與資源再生功能，可更有效利用能量，資源可以自動進行再生。』
衆人看完後皆是目瞪口呆，一下子反應不過來，全都陷入沈思中，整理這些突來的變化訊息。就在大夥楞神之際，小智的聲音傳來了，他說：『桃源系統發佈新主線任務，主智腦必須帶領副智腦羣完成亞蘭神迷蹤探索任務，任務等級：困難（任務等級分爲五類，簡易、普通、困難、極限和超越），完成後視完成狀況給予相應獎勵（完成等級分爲勉強、一般、優良、完美與卓越），失敗懲罰：降主系統等級一級，無即可降抹殺，任務內容：簡易級-找到亞蘭神及5位神使的駐地，普通級-甦醒亞蘭神及其5位神使，困難級-恢復亞蘭神及其5位神使領域被破壞的生態，極限級-復原亞蘭神及其5位神使領域被毀滅的生物，超越級-送亞蘭神及其5位神使返回原家鄉，任務時間：一年內，超過視爲任務失敗』。
又過一會兒，小智的聲音又再度響起說：『開啓支線任務5個，第一個：完成桃源第一個秘密基地建設，第二個：完成桃源團隊第一批內環人員與外環人員的組織，第三個：完成咆哮祭壇有關的探索，第四個：找回2號心核，並融合到桃源系統中。第五個：透過位面交易累積資金達到500萬國際幣』。
一連串的任務發佈聲，讓丁宇他們又是一愣，不過這次丁宇很快就回過神，他決定先把組織設定好，就問：『小智！這個組織權力如何進行？』。
小智答道：『現在所有的成員都屬於核心成員，也就是生物智能，宇哥爲生物主智能，其他成員爲生物副智能，另外一方面，我與夥計、小維、金剛爲系統智能，現在升到8級，系統又有兩組系統智能可以領取，分別是黑客智能與探索智能，黑客智能-可侵入任何現存環境中的電腦系統，並取回指定項目的資料；探索智能-可探索半徑500裡球體範圍，可偵察所有一定指定項目的情況，進行組織功能前，必須先分配生物副智腦羣的擔當與掌控範圍，必須以副系統爲項目，生物主智能只能擔當控制副系統，掌控爲全權。所以各位兄姊，你們先領取一下系統智能，然後討論一下如何搭配擔當。』說完就拿出一組桃樹圖案的紋身貼紙，一組蝙蝠狀的吊墜，然後又說：『紋身貼紙是不會褪色脫落的，他會深入皮層，請貼在左上臂，這是黑客智能。吊墜請加掛於項煉上，這是探索智能。請命名並進行鎖定授權』。
丁宇想了一下，心中暗道：『以前都以男性名字爲主，現在取個女性化一點的，看會有什麼變化？』隨即他就說：『黑客智能稱爲小思，探索智能稱爲珍妮！』一串程序後，就聽到一個極溫柔的女性聲音說：『各位兄姊好！我是小思，以後所有關於電腦系統都可以交給我進行處理，我可以取回資料，可以監控，可以開發程序，但不能進行破壞，有需要時請隨時找我』。
又一個比較剽悍成熟的女性聲音傳出，說：『各位兄姊好！我是珍妮，以後所有關於偵搜探勘的行動都可以交給我，我可以獲取一切情報，可以繪製地形，可以判別物種，但不能進行直接採集，有需要時請隨時找我』。
大家也都一一和他們打招呼，然後進行副系統擔當的討論，最後決定：李明負責生態副系統，周靜負責維護副系統，傅筱語負責倉儲副系統，張偉負責智能副系統，孫婉負責輔導副系統，錢鷹負責神經副系統，朱秀燕負責傳送副系統，石茹負責資料副系統，林衛華負責能量副系統，掌控權限皆爲全權，如此一來核心架構算是完成了。
小智接著說：『現在覈心成員與擔當都完成任命了，可以進行內環人員的選擇，內環人員最少需指定一人後，纔可以進行外環人員的指定，協約人員可以隨時安排。人數限制：外環成員人數最多隻能爲內環成員的5倍，內環成員人數最多隻能爲核心成員的5倍，也就是說外環成員人數最多隻能爲核心成員的25倍，可以晉升，但晉升過程必須按系統規定授權鎖定』。
丁宇心想：『雄獅小隊應該可以成爲內環成員，依格辛應該可以成爲外環成員，其他只能慢慢找了。』心中有定計後，又問小智說：『那現在可以開始生產智能機械人了嗎？』小智回答說：『現在還不行，必須在指定秘密基地後纔可以進行系統升級後的一些功能，包括內外環成員的指定與授權。』丁宇仔細想一想後也深感有道理，轉頭跟大家說：『既然是這樣，那麼我們就先進行秘密基地的建設吧！大家都提提意見...』。