眼看就要演變成一場畿內慘劇的時候，突然從河內國傳來一則驚天消息，原來是去年辛苦攻下的河內國高屋城再次易幟，河內守護畠山高政在半個月前趁着朦朧夜色奪取高屋城，並再次聯合大和國人衆，紀伊國人衆及僱傭的根來衆對河內國展開一連串眼花繚亂的收復行動。
三好軍中的河內國人軍陷入動搖之中，大將遊佐信教二話不說拋下一句話，說是要帶着八千餘河內國軍勢返回河內國“圍剿畠山高政”，就這麼大剌剌的離開三好長慶的本陣回他們老家河內國去，結果剛回到若江城就“很不幸”的被畠山高政“俘虜”，八千軍勢順勢降服在畠山高政的旗下。
眨眼之間，畠山高政便糾集大和國人衆一萬五千軍勢，河內國人衆一萬五千軍勢，以及紀伊國人兩千軍勢，根來衆三千軍勢，湊集三萬五千大軍對和泉國發動進攻，這下又捅到和泉國人衆的要害，陷入動搖的和泉國人衆五千軍勢也紛紛脫離陣線逃回自己家鄉守衛本土，整個畿內的局勢瞬間面臨土崩瓦解的局面。
與此同時丹波國中也出現不穩的跡象，波多野家與丹後一色家、播磨別所家勾結企圖顛覆三好家的支配權，東播磨國人衆二話不說脫離京都改走丹波國取道返回播磨領地，內藤宗勝這個丹波守護代也進退兩難，配下的丹波國人軍早就對如此不惜血本的進攻幕府頗有怨言，聽聞自己的老家出現變亂就更沒心思作戰。
內藤宗勝被諸將一鬧也沒有心思再進軍洛中。三好義賢方面的情況也不太好，隨着河內、和泉國人先後脫離陣線返鄉守土。攝津國人衆也出現不同程度的騷動，攝津有力國人衆首領池田長正就提出回鄉守衛領地，防止播磨的局勢出現逆轉。
三好長慶面對這麼詭異的局勢也很頭疼，內藤宗勝眼看就要率軍返回丹波國鎮壓異動，三好義賢所部也因爲數千軍勢擅自脫離而陷入混亂之中，而三好長慶的本陣更是走的還生剩七千軍勢，這讓他已經很難再保持進攻的局勢。
可剛過桂川來到京都城外就要撤退實在有些不甘心，他原定的計劃是要趁機殲滅六角義賢、中條時秀所部。然後趁着他們兩家軍勢皆喪的大好時機一舉吃掉山城國、近江國，到那時三好家就真正意義的稱霸畿內，再也沒有人能撼動他的權威。
俗話說謀事在人成事在天，任他三好長慶的計謀再高妙可無從施展總是沒有用處的，畠山高政那個夯貨家督又糾集一幫烏合之衆打和泉國的消息已經傳入京都，殘餘的近兩萬幕府聯軍必然會士氣大振，本來板上釘釘的殲滅戰又起波瀾。想再殲滅這兩萬軍勢可就要消耗兩倍以上的力氣。
畠山高政能不能打下和泉國到是次要，重要的是他若不迴轉大軍殺回去救援和泉國，就會給許多潛在的敵人跳出來煽風點火的機會，說不定本來安定的攝津國也會再起波瀾，還有那個因爲細川持隆之死怒而前往周防國大內家的足利義維，說不定又會被阿波細川氏的殘黨請回來生出變亂。
還有不知情形的丹波內亂。東播磨別所氏、丹後一色氏這種向來老實聽話的國人的詭異表現，都預示着這後面必然有一隻看不見的黑手主導着畿內的這一波變亂產生，三好長慶心知事不可爲無法再強行殲滅剩餘軍勢，於是就於幾天後向幕府發出和睦的要請。
這次的和睦要請很有趣，三好長慶對幕府宣示三好家對京都當之無愧的支配權。要求幕府放棄武裝改由三好家接管京都的治安稅收，這一要求被足利義輝毫不猶豫的拒絕。幕府能中興到作用萬騎的地步，所依靠的就是對京都的稅收以及各地大名每年的獻金，以及足利義輝充當地區衝突調解員賺來的外快。
其中京都的稅收以及各地大名的獻金各佔據總收入的四成以上，失去任意其一都會讓幕府不可避免的衰落一截，一旦幕府衰落下去就會使得大名對幕府匆匆建立的那點敬畏感再次耗盡，每年的獻金必定會大幅削減，足利義輝本人從各地軍事調停中賺取的外快也會大爲減少，這是一環扣一環的因果關係。
中條時秀與六角義賢也知道三好長慶心虛的很，若不是他們三好家後院起火，絕對不會坐下來和幕府談所謂的和睦協議，於是鼎力支持足利義輝的強硬立場，這樣一來就讓和睦的談判陷入僵局，三好長慶在京都外大營裡痛罵幕府衆不識時務，竟然不願意接他遞過來的橄欖枝簡直不可理喻。
罵完幕府又開始擔心後方老巢的惡劣局勢，雖然這點改變還不至於讓三好家就此陷入巨大的漩渦，可若是他一直拖在京都裹足不前就不好說會變成什麼情形，時間拖的越久惡劣的影響就越深，以後費的力氣也就更多。
就在三好長慶猶豫着是否要該退讓一步的時候，加賀國傳來一連串令人眼花繚亂的消息，吉良家首席大將上杉政虎率領兩萬三千軍勢擊潰剿滅十萬越中一向一揆，並長驅直入殺進八十年沒人染指的加賀國心腹地帶，於手取川南岸以三萬對六萬再殲滅俘虜三萬餘衆，一舉將威名赫赫的加賀一向宗打成半殘。
石山本願寺的僧衆們簡直像天要塌下來一樣，一個個抱着腦袋惶惶不可終日，年輕的法主本願寺顯如忍不住前往京都遊說朝廷，希望拿出一套辦法來遏制吉良家的囂張跋扈，可問題是滿朝文武袞袞諸公都被京都的這場戰火嚇的不敢出門，不是躲在家裡裝聾作啞就是乾脆跑到比叡山、奈良京、高野山避難，哪裡還有人願意爲他得罪風頭正勁的吉良家。
足利義輝第一時間聽到上杉政虎完勝加賀一向宗的消息簡直興奮的要手舞足蹈，這是他第一次體會到有位忠勇可靠的一門衆是件多麼重要的事情，上杉政虎這三萬虎狼之師橫掃加賀的情報就像一劑強心劑注入搖搖欲墜的幕府之中，他立刻命令幕府動用各種力量大肆宣傳，儘量要讓聲勢變的驚天動地人盡皆知纔好。
於是足利義輝親自誇讚的“東國第一武士”以及“越後之龍”、“北陸軍神”的名號逐漸爲人所知，吉良義時在下向越後幾年的神奇表現也被人們再次挖掘出來反覆熱炒，以前畿內的輿論總覺得吉良義時再厲害也只是在遠國，距離天下心腹的畿內還遠的很。、
可隨着加賀半國被奪的消息傳來，人們才發覺吉良家已經不知不覺的來到近畿之外，只需繞過越前朝倉氏就可以重臨京畿，那個叱吒京都三年並創造一連串難以置信功績的傳奇人物，似乎又要重新躍入人們的視線之中。
要說誰對吉良義時迴歸京都最緊張，那首先要屬畿內霸主三好長慶，他用十年的時間在京都這個泥沼裡走了個來回，時至今日眼看就要馬到功成的當口，吉良義時就像陰魂不散的夢魘，突然從一個任何人想不到的角度殺出來，把三好長慶嚇的心都快蹦出來。
自從得到這個消息，三好長慶就被驚擾的寢食難安，暗中思索着：“這個吉良義時怎麼又殺回來，他不呆在北陸關東和相模北條氏、甲斐武田氏糾纏就對畿內方向亂伸手，難道真的要上洛嗎？不行！絕不能讓他得逞！我三好家要稱霸畿內建立不下細川家的霸業，怎麼能在這個時候讓吉良義時亂插手壞了本家的好事！得儘快想個辦法對付他才行！”
還沒等他想好應該做的動作，又聽說本願寺顯如甘願低頭認輸換來吉良家的不戰和睦約定，強極一時的加賀一向宗就此成爲昨日黃花，那加賀半國領地從此就是吉良家的領地，如此驚人的變化讓三好長慶難以理解其中的反覆，他不明白這領地什麼時候變的這麼容易奪下，以至於石山本願寺連掙扎反抗的意圖都沒有就俯首認輸。
足利義輝迅速行動起來決定給予吉良義時加賀守護的名號，並鼓勵他儘快上洛進京保衛幕府，三好長慶急的一連幾天都無法安睡，三好家臣團內部的異議聲音越來越多，有許多人覺得此次上洛還是有些倉促，身後老巢的安穩的有限度應該高於上洛，話裡話外無非是告訴三好長慶這戰爭不能再打了。
說這些話的人還不是基層國人地侍，而是三好家的一大堆一門衆和準一門衆，他們支持三好長慶上洛是爲利益而來，死命拼殺一整個夏天現在連丁點利益都沒見到，反倒是各自家族損兵折將虧的不輕，眼看這麼搞下去對自己極爲不利，三好長慶只得招來三好義賢、鬆永久秀商討一夜，於第二天再次向幕府提交和睦要請。
這次和睦要請經過仔細修訂，首先承認幕府對京都的控制權及治安管理權，但是京都的防衛力量必須要與三好家共享，二條御所留守軍勢不得超過五百人，其餘兩千軍勢則轉移到京都東部的慈照寺內駐守，三好家也會派出五百軍勢由三好長逸率領駐守京都南部的東寺，並將細川氏綱留在東寺作爲管領的行轅。
三好長慶身爲管領代，將擁有率領五百軍勢進出京都的特權，並將每個月定期行使御相伴衆的權力，前往二條御所與幕府將軍共進午餐以增進雙方的諒解與互信，吉良家及六角家無公方御教書不得進京，不得插手京都防衛治安事物等等各條例，另外還有三好長慶將東寺當作京都拠點的具體庭院的位置等都做出一一標註。