王璟在仙靈島中問清楚趙靈兒的年紀，原來趙靈兒才滿十六歲，故事應該很快便要開局。王璟有心改變一下仙劍一中某些人的悲劇命運，便做出了一些謀劃。
王璟靜待拜月派出的黑苗武士驅使李逍遙上島，趁機擊殺了這些黑苗武士。姥姥見已然無法避免拜月的追殺，便委託王璟保護趙靈兒。王璟趁機便收了趙靈兒和李逍遙爲徒。
在仙靈島上，王璟設置了由五行和陰陽組成的大陣，除非有控制陣法之人允許，不然沒有人能夠上島。保證了仙靈島的安全問題，便帶着木婉清，綰綰，石青璇，李逍遙和趙靈兒往南詔國而去。
途經餘杭鎮的時候，衆人遇到了酒劍仙慕一兮，酒劍仙被王璟所迫，不得不屈從，也跟着去了南詔國。
在林家堡，王璟惡趣味叢生，又收了劉晉元和林月如爲徒。一行人浩浩蕩蕩，從江南往南詔國而去。
隱龍窟的蛇妖，狐妖，以及兩妖的女兒，被王璟治的服服帖帖，無奈相隨。
黑水鎮的殭屍問題，其實是土靈珠作祟，王璟利用達摩之淚，解救了衆村民，完美解決。
在將軍冢裡，赤鬼王被衆人遇到，自然也被斬殺了。王璟取得土靈珠。
處理完這些事，衆人便遇到前來迎接趙靈兒的石公虎長老，唐鈺小寶和阿奴。石公虎此人忠君爲國，卻是古板之極，和衆人相處的不太愉快，但阿奴和唐鈺小寶卻是和衆人打成一片。
石公虎說起南詔國的現狀，以及養大了拜月教主的悔恨，引得衆人紛紛責罵拜月教主。而王璟卻不這麼看，拜月教主此人小時候有主見，但被石公虎錯誤粗暴的教導，以至於心生叛逆，走向極端。王璟自恃可以改變拜月教主這種畸形的世界觀，因爲拜月教主是聰明人。
衆人到了南詔國的時候，巫王一如既往的軟弱，拜月教主卻是表現出一副文雅的樣子。石公虎聽趙靈兒說王璟有神龍，而且看不清楚王璟的境界，便知王璟深不可測，多次懇切王璟出手，擊殺拜月教主，王璟卻是表示要跟拜月教主好好談一談。
王璟先是同拜月教主論文，兩人就詩詞歌賦，醫卜星相，建築，機關，治國，音樂，宇宙等等問題進行探討，拜月教主發現王璟好像什麼都會，見識還在他之上，大爲驚歎，自認不如。
兩人論文完畢之後，又開始論武。拜月教主雖然是法相巔峰修爲，但王璟是法相中期修爲，又有摩訶無量和從神秘玉符中參悟的大道符文相助，激戰半天，最終拜月教主落敗。
石公虎見王璟竟然能夠擊敗拜月教主，再次懇求王璟擊殺拜月教主。然而王璟卻沒有動手。
拜月教主便跟王璟請教，說出了他的疑問，這世間到底有沒有愛的問題。
王璟當然知道這種由於教育問題引發的心裡故障要如何解決，當即就把心理學，社會學，以及何爲愛，細細講解。
拜月教主論文論武都輸在王璟手上，對王璟的武道，見識都很佩服，聽了王璟的分析，深覺得有道理，便打算暗自王璟的要求試着改變一番。
在王璟的提點下，拜月教主先是讓教衆多爲民造福，又通過溫和的手段懲治那些國家的蛀蟲，而不是一刀切的方式。這麼一來，南詔國的百姓從心裡由衷的感激拜月教主，石公虎見得拜月教主種種改變，雖然不承認自己錯了，但再沒有說什麼要擊殺拜月教主的話。
於是，仙劍一位面最大的boss拜月教主就這麼被搞定了。
拜月教主的事情一搞定，王璟讓趙靈兒帶他去女媧神廟，鳳凰便是在女媧神廟駐守，王璟取了一些鳳血，分發給他的衆老婆以及女徒弟。從此，女的修煉聖心訣，男的修煉乾坤無極功，王璟的親朋好友，凡是有資質的，也算是可以長生不老了。
南詔國事畢，王璟便去了一趟蜀山，王璟有心見識一下蜀山的御劍術，便纏着劍聖打了一架。劍聖看王璟對御劍術感興趣，但打着代師收徒的幌子，好拉攏王璟。王璟樂得其成，如此也可以學得蜀山的道法，便順水推舟，也加入了蜀山。
王璟在蜀山學完道法，便去了鎖妖塔，順便解決了姜明的問題。至於鎖妖塔裡邊的窮兇極惡的妖魔，卻是倒了大黴。王璟這麼一搞，鎖妖塔頓時空了許多。劍聖見王璟要把鎖妖塔給玩壞，無奈只好讓王璟出去雲遊。
王璟帶着衆人，便四處遊歷。途經長安郊外，又指使劉晉元救了蝴蝶精結綵衣，擊殺了蜘蛛精，劉晉元由此和綵衣走在了一起。王璟從蜘蛛精身上取得雷靈珠。
遊歷完之後，王璟又從鳳凰和麒麟那裡取得風靈珠和火靈珠，在餘杭鎮找到了李逍遙小時候的玩具水靈珠，五靈珠便合爲一體。
五靈珠聚齊，藉助其神力，趙靈兒和王璟兩人突飛猛進，王璟和趙靈兒在仙劍一位面便突破到了虛仙境界。
藉助趙靈兒的造化大道製造出一個新的身軀，王璟又分裂元神，造了一個分身。以元神分身催動戰神殿去風雲位面陪着任盈盈，黛綺絲，周芷若，趙敏，黃蓉和駱仙，本體在仙劍一位面陪着綰綰，木婉清和石青璇。
至於仙劍一衆人，唐鈺小寶和阿奴在一起了，酒劍仙莫一兮和聖姑在一起，李逍遙娶了趙靈兒和林月如。
天界之主天帝見趙靈兒越來越強大，命運已然發生改變，便降下天罰，妄圖毀滅趙靈兒，可惜，天罰雖然厲害，但還奈何不了虛仙境界的趙靈兒。天界之主又催動五魔獸，意圖擾亂人間，被王璟，拜月教主，趙靈兒聯手給摧毀了。
天界之主終於忍不住要親自出手了，王璟見無法抵擋，便帶着衆人躲進玉符之中，逃到了西遊位面，準備修煉成仙之後，再回仙劍位面，上天界找天界之主報仇。
王璟在西遊位面，才知道了自己的神秘玉符正是鴻鈞老祖的造化玉蝶殘片。西遊位面仙氣濃郁，衆人皆默默修煉，等待迴歸的那一天。