人型生物身上穿着的東西被稱爲是納米生化服，但它跟納米材料沒有一毛錢的關係。
在六千萬年前來自M33星系可以稱爲ceph的殖民者就到訪過地球，但是因爲氣候問題陷入了休眠。
在這個世界20世紀初的通古斯大爆炸，是三個人無意之間激活了一處ceph的基地自毀程序，三人見識過了這種被他們稱爲ceph的生物的恐怖與強大的科技。
其中兩位分別叫做哈格瑞夫與羅許，他們藉助ceph的生物實體開發出了早期的納米生化服。
這種裝甲幾乎能適用一切戰鬥，它還有着各種強化模式，裝甲模式能抵禦槍炮，威力增強能讓人跑得更快跳得更高，隱匿模式的隱形甚至覆蓋武器。
之後在一處被稱爲靈山島的地方發現了ceph的基地，就此開展了孤島危機1的劇情。
而在靈山島事件後，人類明面上取得了勝利，但實際上ceph在世界各地的大城市都秘密建造了巢穴。
紐約的巢穴最先復甦，人類在ceph創造的感染病毒前沒有任何抵抗能力。
原本一代故事中納米生化小隊的指揮官，代號‘先知’的巴恩斯·勞倫斯，就算是有與ceph同出一源的納米生化服，但因爲種種原因還是感染了病毒。
在‘先知’死去之前，他在海邊救下了來援卻被覆滅的特戰小隊中的一員‘阿卡特茲’，將身上的納米生化服讓給了阿卡特茲。
重傷的阿卡特茲藉助着納米生化服見到了活了一百多年的創造者哈格瑞夫，併成功拯救了城市。
然而，在這個過程中，重傷的阿卡特茲神經逐漸崩壞，他的人格也消失了。儲存在生化服中的先知意識被釋放了出來，重新復活。
世界各地有ceph的巢穴，在紐約戰鬥中，CELL發現了其中的主腦，修建了X系統將其控制了起來，從主腦身上掠奪巨量的能源，通過對ceph的研究大發戰爭財，並逐漸控制世界。
先知也被CELL捕獲了起來，準備切開他研究納米生化服。
納米生化服有一個最獨特的性質，那就是永遠只有第一任宿主才能完全匹配。生化服會逐步的記錄宿主特性，並與身體融合。先知能借屍還魂，就是依靠了這一特性。
這也是爲何剛剛賽可會說‘他們剝了我的皮’的原因，將納米生化服完全剝離，痛苦不亞於剝皮。
納米生化服與141特遣隊的生化改造，兩人都在暗中較勁。
拳掌之間開始了發力，腳下的水泥開始崩碎。
一旁的賽可舉槍對準了麥克塔維什，這個看起來就很強大的壯漢不斷在取得贏面，先知甚至被他推後了一些。
驟然間，兩人收起了力氣。彷佛剛纔一切都沒發生。
暫時間無法在力量上取得優勢，而對方也沒有發動其他攻擊，先知決定先問問。畢竟沒有人對他如此瞭解，從名字的問詢中就展示了太多的隱秘。
“你可以叫我‘先知’！”
先知只是一個代號，而這個代號卻是貫穿整個事件始終的人物。他們不是一個人，是巴恩斯·勞倫斯，是阿卡特茲，是幡然醒悟的哈格瑞夫……
賽可看着從海中爬出來跟牧羊人回合的霍爾特，在一旁舉着槍來回巡視，這兩個大傢伙的交流纔是重點。
賽可催促着說道：“如果你們不準備打，那就趕快說清楚！”
麥克塔維什轉頭看着沒事的牧羊人，對眼前的先知說道：“我們是時空管理局下屬的141特遣隊，奉命來處理這個世界的覆滅危機。”
“你到底在說什麼？你該不會是那羣CELL的混蛋用外星章魚製造出來的吧！”
賽可率先發表了意見，他無法理解自己認知以外的事情。
先知從上到下看着麥克塔維什，說道：“掃描顯示你的骨骼已經被替換成了金屬，肌肉被強化，身體每一處都有生化改造的痕跡。但是沒有ceph的基因。”
麥克塔維什說道：“我不是你們世界的人，要維護各個世界的和平穩定，需要這樣的力量。”
先知伸手按下了一旁賽可的武器，說道：“賽可，冷靜點，他沒有說謊。”
納米服集成了多種探測設備，能掃描人體，自然也能監測聲紋和心跳測謊。
“可……可是……這麼可能！”
賽可不敢置信的喃喃低語，時空管理局光聽名字就能知道它的地位和職責，現在這個世界有覆滅危機？我的世界要毀滅了？
麥克塔維什這次看向了賽可，解釋說道：“根據我所得到的命令，和已有的情報顯示。在人類的高層中出現了叛徒，CELL已經無法收容外星ceph的主腦。”
賽可破口大罵道：“法克！我就知道這幫傢伙沒幹好事！肯定是CELL的高層，他們跟外星人有一腿！”
然而麥克塔維什略帶嘆息的看了賽可一眼後，說道：“並且X系統的傳遞中樞是CELL創造的毀滅性武器，它能利用無線輸電遠離將ceph主腦的能量輸送道太空衛星，能量轉換爲基本粒子。全力輸出幾乎能貫穿地球。而他們應對穹頂牢籠收容失效的唯一方法就是用這武器對着紐約來一發……”
賽可已經不想再說什麼了，內憂外患下他已經不想再思考了，他無力的蹲在一旁，現在只想來根菸。
“這樣的衛星，CELL一共有十二顆！”
賽可擡起頭看了麥克塔維什一眼，又低下了頭。按照反抗軍的計劃，他們會和先知一同推翻CELL技術的核心，炸燬X系統中樞。
而按照麥克塔維什的說法，炸燬X系統將會讓收容的ceph主腦逃出來，讓CELL朝地球來一炮。
‘算了，累了，毀滅吧……’
這時候，一旁的海洋中出現了一些波瀾，隱形的小型飛行器緩緩降落在衆人面前。
一個靚麗的少女和在駕駛室抽菸的克里斯出現在了現場，少女跳下飛行器對着麥克塔維什點頭示意。
瑞貝卡·錢伯斯，從十八歲大學畢業就加入了浣熊市的STARS小隊擔任醫療官。而在後續的故事中，她就像是被卡普空忘記了一般，只在一部CG電影中出現過。
但出場戲份少不代表她的能力弱，十八歲大學畢業，經歷過生化危機，更是在紅後的培養下成爲了小浣熊內首屈一指的生物學家。
面對ceph散發出的病毒，小浣熊才應該是最佳應對人選。
但納米生化服技術卻是141特遣隊的預定戰利品，一種能擬合身體的生物作戰服，可以充當保護和內襯，甚至還能讓他們在太空短時生存。
在故事的最後，先知從衛星軌道墜落地球，反而融合了整個納米生化服重現人類外貌。
這樣的裝備，纔是141特遣隊需要的。他們需要納米生化服作爲戰鬥機甲的內襯和保護。
而瑞貝卡這位前線生物學家就被申請了過來協助行動，作爲回報，幽靈帶了一支小隊也去協助小浣熊。
在生化病毒的作用下，現在的瑞貝卡也像是大學剛畢業那樣年輕。
她提着一個箱子來到了先知旁邊，打開露出裡面的裝置。
指着一個針刺位置，瑞貝卡說道：“把手放在這裡，我需要提取一點你的組織細胞。”
先知沒有行動，而是等待着說明，他現在能依仗的就這一身納米生化服，雖然剛纔的解釋說明沒有探查出謊言，但對方也是改造人，不能不警惕。
“呃，好吧，看來只能用口頭說明了。這臺機器能提取你的生物信息，將一些情報內容插入到你的衣服中，這樣就不用通過文字影像的物理媒介留存信息了，這也算是一種保密手段。”
隨着瑞貝卡的說明，先知將信將疑的伸出了手，同時他身上的納米生化服有了輕微的變化，看樣子先知也做了防禦準備。
針刺入了納米生化服中，先知從裝備中感受到的是一些神經細胞被注入，這些神經細胞儲存的記憶被釋放了出來。
那是時空管理局的存在說明，以及一些對於這個世界的情報預測。
而這時，先知也知道爲什麼剛剛麥克塔維什看賽可的眼神爲何那麼奇怪了。
先知對蹲在地上的賽可說道：“賽可，我們得離開了！”
站起的賽可隨意的讓槍掛在胸前垂落，無所謂的說道：“你跟他們去吧，我反正找你來是想要摧毀X系統，但我們的想法在一開始就是錯的。你選擇了相信他們，我選擇相信你。”
沒有人能用幾句話就讓人信服自己完全陌生的事物，羅夏當初忽悠紅後還展現空間能力和自己的各種裝備呢！
作爲戰友的賽可選擇相信先知，相信這個從一開始就站在抵禦ceph入侵最前線的男人。
克里斯在一旁看着戲，隨即看向了一旁，接着對麥克塔維什說道：“地獄犬發現了有人靠過來了，剛剛的屍體還有半分鐘就會被發現，要我動手嗎？”
“不用，我們儘快離開。”
隨着麥克塔維什的話音落下，一架軌道突擊艇驟然躍遷在衆人面前。克里斯慢悠悠的將自己的小飛船開進突擊艇裡。
麥克塔維什對着失落的賽可說道：“我們還需要你指明位置，接下來拯救世界的行動需要反抗軍的努力！”
“走吧，賽可，接下來也需要你幫忙！”
先知對着賽可伸出了手，跨越幾十年後，戰友的手又握在了一起。
軌道突擊艇，能配得上這個名字的裝備有着絕強的護甲護盾，還有最強的動力。
看着一旁的克里斯、瑞貝卡和牧羊人紛紛抓住了一旁的護欄，賽可也默默伸手將手放在了上面。
“我們要去穹頂的另一側，在圍牆下有一處反抗軍集結地。希望我不會把災難帶給他們……”
剛剛說完，賽可就感受到了一股巨力，他整個人就像是被車撞了一般騰空而起，一旁的先知連忙抓住了他。
可是賽可帶來的兩個行動人員就沒有那麼好運了，他們僅僅的貼在了軌道突擊艇後方的艙門上，掛在上面一動不動。
隨着兩個倒黴蛋的落地，突擊艇也來到了賽可說的位置。
鋼鐵穹頂如同天幕一般將一切都包裹在了裡面，而賽可說的位置，卻在裡面。
揉了揉自己手腕上的抓痕，賽可說道：“我知道一處泄洪渠，我們要趴着才能過去。或許對你來說有點小？”
賽可說的是麥克塔維什，他現在的身高爬防洪渠，的確是強人所難。
克里斯在一旁無所謂的說道：“或許我們有更乾脆點的辦法！”
乾脆點直接把天幕轟開，大搖大擺的把突擊艇開進去。
瑞貝卡忍不住用手肘頂了一下克里斯，然後對着賽可笑了笑，示意他無視自己旁邊的傻子。
最總衆人還是選擇了跟隨賽可的引路，他們可不會選擇破壞穹頂，那是阻擋ceph主腦的第一道防線，破壞它就是在協助主腦逃脫。
那狹小的排水渠對於先知來說通過都很艱難，賽可壞笑着帶頭爬了進去，接着是瑞貝卡。
而當賽可出來時，他轉頭卻看到了站在一旁的麥克塔維什。
“法克！你怎麼過來的？”
“走過來！”
麥克塔維什自然不會說他們身上都有信標，只需要瑞貝卡過來之後開一個傳送門就能進來。
在徹底解決這個世界的隱患之前，麥克塔維什不會輕易暴露這種工具。
“走吧，我們去見見反抗軍。”
麥克塔維什催促着賽可，賽可嘟囔着開始胡亂猜想。
帶路的他沒有看到，麥克塔維什將一把武器交給了先知，兩人心有靈犀的互相點頭，然後跟了上去。
而原本應該在的瑞貝卡、克里斯和牧羊人則消失了蹤跡。