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當太乙等幾人向元始說打神鞭被奪之事時，元始沒有任何表情，只是淡淡地道：“知道了。”
元始永遠是這種表情，好象沒有喜怒哀樂一般，在別人看來這是修行高深的表現，而對於元始來說，他生來便是如此。
太乙等人退下之後，元始明白奪走打神鞭的只能是申公豹的人或是陸壓等人。當時他失去的確實只是一個分身，這樣的分身力量還不及他本身能力的十分之一。因爲連他自己都已經記憶不清自己活了到底多少個年頭了。
剛開始的時候他已經記憶不清自己是如何來到這個世界上的。當時他只是一團純青色宛如飄浮的流水一般的東西，沒有意識，沒有思想。
看着這山洞中央猶如一隻破卵一般的容器，元始當時便是從這容器之中流淌出來的。那時候他什麼也不知道，什麼也不會思考，只是在這山谷之中四處遊蕩。直到這白雲籠罩之下的山谷中來了第一個訪客，當這個訪客與他接觸的時候，他莫名其妙地就吸收了這個訪客的魂魄，這纔開始慢慢地有了思想的能力。
從這個訪客的意識中，他知道了外面的世界，開始走出這山谷，觀察世界。世界上有很多人，有很多種生活，很多種新鮮的東西和事物。他接觸到了一些元神族人，這些人的能力他只要看上一遍，大部分的能力他便可以使用出來，彷彿他是一個煉氣的天才。但從這時候，元始也開始發現了自己與其它生物，與人類的不同。
他不知道自己是誰，自己是什麼，他幾乎走遍了整個世界，但卻找不到任何一個自己的同類。他回到崑崙的山谷之中，從世界之中學來的東西讓他發現了這個地方的不同，這裡的東西雖然不多，但是都是這個世界上所沒有的。
比如那隻破碎的卵形體，構成它的物質完全不是這個世界上所有的物質。在這裡有一些被元神族人稱爲先天法寶的東西，比如當時給清虛的那件紫綬衣，比如那圓球狀的太極圖。這裡的一切都和這個世界格格不入，彷彿來自己另一個世界。
因爲他自己是沒有那種脆弱的肉體的，看着一茬茬的人類肉體死去，魂魄消亡，而他卻依然存在着，沒有一點點衰老的跡象。他和這世界上任何一種生命形式都不同！
但元始發現自己和這個世界上人類的唯一共通之處便是元神。他彷彿是一個天生的沒有肉體依附的元神，這些元神族人的能力纔可以和他自己有一點點相似之處。爲了尋找自身的秘密，於是他開創了崑崙，開始廣收元神族人，利用自己長生的廣博見識和對元神的瞭解，很快在使崑崙成爲世界上最多元神族人的煉氣門派。
也不知過了多少年，他對元神的瞭解越來越豐富，並且，他發現了在元神之中還有另一種東西，那就是魂魄，所有的元神都來自於不同的魂魄。
就象人類的基因導致了人類肉體的不同一般，魂魄導致了元神的不同。而且魂魄與肉體之間看似聯繫緊密，但事實上，魂魄似乎開始時並不屬於肉體，而且在某種情況下，魂魄在離開了肉體之後仍然可以獨立生存。肉體也一樣，沒有魂魄的肉體在某種情形下也可以無知覺地存在。
而元始自己，便彷彿是一個介於魂魄與元神之間的存在，沒有肉體，沒有魂魄的存在着。
元始仔細研究過人魂魄的誕生，剛出生的嬰兒似乎沒有魂魄，但是彷彿無中生有一樣，一坨糞開始時裡面什麼也沒有，但是很快就會滋生出一些細小的蟲菌一般，魂魄無中生有地自肉體中慢慢出現。元始怎麼也研究不透魂魄是如何從肉體中生長出來的。
而他自己，又是如何產生出來的呢？山洞之中那枚卵狀物，元始也不知道研究了多少年，但無論怎麼看，那都是一個沒有生命的東西，不可能會產生出自己。
最終元始發現，自己和這世界唯一的聯繫，便是元神與魂魄。元始收過的徒弟之中，有很多人的能力，特別是體能方面的能力他都可以很快地學會並使用，比別人的能力更強。但也有一部分，大多是念力思維方面的能力，他卻無論如何也學不會。
對於崑崙遺留下來的那些黃巾力士的研究，他懷疑在很久以前自己的同類曾經大量地遍佈在這個世界上，因爲依據黃巾力士身體的強度，除非是自己，否則現在的人類根本無法損傷它們，但是黃巾力士身上的那些傷痕，證明了只有和自己一樣強大的人才可以傷得了他們。但那些人不知道爲什麼現在全部都消失不見了，只剩下他一個。
當他偶然間收到普賢這個另類的徒弟，對魂魄的認識更加深入的時候，他開始想到了一種可能：也許久遠以前的自己的同類退化或是發生了什麼巨大的變故，能力衰退了，成爲了現在的元神族人，而自己在這枚卵中，雖然生存了下來，但是能力卻也不知爲什麼缺失了一部分。
因爲所有的元神族人都和自己有着相似之處，而元神之間的差異又是來自魂魄的微小差異，於是元始產生了一個大膽的想法：把這些所有的元神族人的魂魄收集起來，和自身融合，也許便可以找回一個完整的自己。於是他便着手藉着商與西歧的戰爭，製造了這次收取靈魂的大行動。
由普賢和他利用崑崙裡遺留下來的一件法寶，改造製作出了這件可以收集魂魄的打神鞭，然後將元神能力爲蠱惑的狐形元神附身在妲己身上，製造出一個令大商自亂的女人，以製造伐商的戰爭藉口，派申公豹去將元神族人煉氣士引到這次戰爭中來，便於收集足夠多的元神族人魂魄。
因爲他的能力不在於念力方面，所以他並不能如申公豹一般可以使用許願石觀察到世界上每一個地方，所以他並不知道陸壓等人的位置。太乙等人告訴他打神鞭被奪之後，他首先要去找的便是申公豹。
元始騰空而起，穿過崑崙之上的雲海，直飛申公豹所在的西北方位。申公豹所囚的地方也是一個讓元始感到無法索解的所在，那裡彷彿是連接着另一個空間一般。當時他的一個分身發現這個地方時，也沒能走得出來，進入那個空間的黑暗之中也沒有找到出口，至今也沒有出來。
元始也在暗暗思索，如果申公豹以打神鞭爲要挾，要放他出來該怎麼辦？經自己本體的能力能不能突破那個無形的禁錮呢？當然，最好打神鞭不在申公豹手中，在陸壓等人手中倒是容易得多！
來到申公豹所在的位置，元始落下身來，申公豹正躺在那凹陷之內呼呼大睡，身邊放着烤熟的食物和一罐酒。那隻打神鞭就放在他的身邊，看來申公豹果然和外面的人聯繫上了，這打神鞭果然是申公豹奪來的。
申公豹一直是元始看重的一個人，這個人雖然不是元神族人，但是對於術法的理解和運用是自己這麼多年來收徒中所不多見的，對於許多問題能夠舉一反三，特別是對於人類肉體構成的想法（就是申公豹知道的二十一世紀關於基因的問題）非常獨到。所以元始當時纔沒有殺他，而是把他囚在這裡，也許以後還有用得着的地方。
元始走到凹陷旁邊，道：“公豹。我來了，你想要什麼？”