妖族起兵數百萬進攻巫族共工部落，洪荒俱驚，遊離在巫妖二大勢力之外的修行之人，爲求自保，皆盡數逃離洪荒，或避居海外，或隱居於大山沼澤，不敢出頭。
巫族有數以千萬計的巫衆，且巫族之人生就性情耿直，豪爽，無論大人、還是小孩，天生就具有巫力，而且十分注重力量，驍勇善戰。雖然平日裡各祖巫部落間紛爭不斷，但一旦爲外族所侵，卻俱能放下矛盾，異常團結。此時，在得知妖族天庭進攻共工祖巫部落，祖巫中的智囊帝江，立刻聯繫句芒祖巫、后土祖巫，讓這兩位善於防守的祖巫帶領所屬巫衆去救援共工，又聯繫其他善於攻擊的祖巫，馬上各糾集所部，整合全族人馬，於洪荒大地各處開始排兵佈陣，集巫族全族之力，要與妖族爭那天地主角，洪荒大陸處處戰火連天，處處上演着以命相搏，亂戰一氣的鬧劇。
無論是山峰、水邊、甚至是巫族的部落之中，隨處可以看到死去的巫妖屍體，盡皆破壞不堪，或缺頭顱，或少內臟，肢體不全者更是不計其數，可見巫妖爭鬥之殘忍絕滅。連番幾場混戰下來，共工、后土、句芒三位祖巫帶領的三方巫衆在洛水之濱成功的將天庭妖族抵擋住，雖然損失慘重，但其他祖巫正集合所有巫族力量源源不斷的向洛水之濱趕來，打算將妖族包圍並消滅在洛水之濱。
妖族見局勢從對自己有利的一面轉眼間轉向了巫族。以帝俊、太一、鯤鵬爲首的妖族急忙商量對策，決定從兩方面下手，一方面關閉天庭，以不周山爲基地，運轉周天星晨，於洪荒大陸布周天星斗大陣，將天庭星晨之中的兵力全部放出，增兵於洪荒大陸，以便應對將要發生的大戰；另一方面，分兵四方，由帝俊、太一、鯤鵬、商羊各帶一支兵力分頭抵擋巫族的合圍。
帝俊此時心中大恨，主動出擊來打援的天吳部落。天吳部落由祖巫天吳帶領，天吳乃是八首人面，虎身十尾的風之祖巫，性格急躁，速度奇快，大戰初起時，天吳一心想要趕到洛水與天庭爭鬥，沒來得及細細準備，倉促之間就帶領巫衆向洛水之濱趕來，其巫衆也俱是擅使風之力量，一路低頭急行趕路，並未注意埋伏在羣山這中的帝俊伏兵。帝俊見天吳部落已入彀中，急忙帶領的妖兵盡出，打了天吳部落一個措手不急。
帝俊心思詭異，知道把這一仗打狠了，纔能有力的震懾巫族，一出手就是大手筆，先佈下周天星斗大陣困住天吳，用周天星晨之力壓制天吳的速度。再派出飛誕、呲鐵、鬼車、獬豸、饕餮等大將纏住天吳部落的各個大巫，自己指揮畢方、窮奇、諸犍帶領妖兵妖將殺入巫族戰陣，天吳部落羣龍無首，一時之間，被打的措手不及，血流成河，煞氣沖天。
帝俊深諳爲將之道，傷其十指不如斷其一指，此時，見天吳被困周天星斗大陣之中，帝俊將指揮權交給了畢方，讓其統領妖族與巫族做戰，自己調整週天星斗大陣，全力發動陣勢，以期在其他祖巫沒趕來之際先行消滅天吳，消減祖巫的有生力量。
一陣陣周天星晨之力不斷向大陣之中的天吳壓來，周天星斗大陣最大的特點是困人，其次是藉助星力進行攻擊。在大陣之中，天吳的速度是使不出來了，但天吳憑藉祖巫的強壯身體一邊抵抗星力的壓迫，一邊對大陣進行着破壞，只見天吳騰空而起，對着壓制他的星晨發起攻擊，一拳下去，星晨掀起一處破碎，化作滿天流星砸向雙方交戰的戰場，無論妖族、巫族被滿天而下的破碎星晨砸死砸傷的不計其數，天吳暴躁，不計後果的攻擊，使自身體力急劇下降，感到星晨之力越來越強，自身巫術漸漸有施展不開的感覺。帝俊立於陣外，不停的調換星晨位置，轉換星晨進行攻擊，不斷的修復破損星晨，也累的氣喘虛虛，但知形勢起碼是壓制住了巫族，只等到天吳力氣用完，一舉發動周天星斗大陣，將天吳化爲虛無，再消滅天吳部落的大巫、小巫，那麼此戰對妖族來說可是完勝。
帝俊計劃的很對，也很好，可是幻想總是與現實之間有那麼一些區別，正當帝俊沉浸在即將勝利的喜悅中時，周天星斗大陣之外騰起一陣金光，以肉眼不及的速度衝向大陣，這衝向大陣者的實力比之天吳還要強，只見衝陣者全身金色鱗片，左耳穿一條金蛇，腳踏兩條金龍，人面虎身，肩胛處生羽翼，正是西方金之祖巫——蓐收。
這周天星斗大陣用於困人是效用無比，但卻是防範不了不入陣的，如果陣內陣外聯手進行攻擊，且每個人的實力都與佈陣者相當，那麼這周天星斗大陣可以說就所剩無已了。帝俊一時氣結，眼看就要成功了，卻被蓐收給攪了，作爲陣眼的河圖洛書不停翻騰，靈寶之內的靈氣因佈陣消耗過大，已然不足，帝俊知道這場戰鬥將要結束了。遂下令收攏妖兵結防守之陣。拒巫族於洛水之濱之外，不讓巫族形成合圍之勢。
這一戰可以說雙方斗的是旗鼓相當，各有損失。天吳迴歸部落，略一統計，這天吳部落可以說是損失慘重，大巫存活的沒有幾個，來的巫衆被妖兵妖將殺死的，被星晨碎片砸死的不計其數，整個部落人員損失過半，氣的天吳略一休整就要出兵與那帝俊再行撕殺。只是被蓐收死死攔住，這才作罷，天吳部落與蓐收部落合兵一處，堪堪抵擋住了帝俊的妖兵妖將，雙方就這樣一直如此僵持着。
東皇太一與強良、祝融、玄冥、翕茲四位祖巫也有過一番惡戰，但是東皇太一手持東皇鍾，攻防一體，將鍾立於頭頂，就可罩定全身，可立於不敗，無論幾大祖巫的雷、電、雨、火俱不能沾身，是真真切切的烏龜殼，而且這鐘每每不敲自響，如洪鐘大呂，震人心魄，四位祖巫合戰太一，每當太一陷入困境之時，東皇鍾必響，直接影響祖巫做戰，不但沒得到什麼好處，反而會不自覺的受到一些傷害，故而大戰也成了僵持狀態。
妖師鯤鵬方面，戰陣比較激烈，鯤鵬爲萬妖之師，自身實力那是沒的說，比之帝俊、太一要高出不少，但鯤鵬與帝江、燭九陰、奢比屍三位祖巫聯合作戰，帝江乃人面鳥身，善速度，四翅一扇二十八萬裡，爲空間速度之祖巫；燭九陰掌管日月運轉，是時間之祖巫；奢比屍掌管天氣，又稱旱魃，是爲天氣之祖巫。
這三位祖巫實力最爲強硬，每一位實力都接進鯤鵬，三打一，壓的鯤鵬喘不過氣來，而且鯤鵬與祖巫作戰缺少混沌鍾、河圖洛書一類的先天靈寶，也缺少趁手的武器。要知道由盤古精血所化成的祖巫的身體強度可是驚人的，一般的兵器打一下不過是撓癢癢。因此，鯤鵬與一個祖巫爭鬥，穩佔上風，與兩個祖巫一起爭鬥，堪堪抵擋的住，但三個祖巫聯手戰鯤鵬，鯤鵬是萬萬不行的。
可是，鯤鵬也有絕招，鯤鵬會變身，有兩種形態，所謂：“北冥有魚，其名曰鯤，鯤之大，不知其幾千裡也；化而爲鳥，其名爲鵬，鵬之背，不知其幾千裡也，怒而飛，其翼若垂天之雲，扶搖直上九萬里，絕雲氣，負青天。”故而鯤鵬能控風，天地之間的風爲其所有。若三位祖巫齊上陣，鯤鵬一怒變身爲鵬，其形巨大，掌控天地間的風之力，藉助風勢，速度比帝江要快上不少，其左抵右擋，也能與三位祖巫鬥個齊鼓相當，但每次交戰也是傷痕累累，這讓鯤鵬大爲窩火。因此，鯤鵬方面的戰陣也算是相持不下。
巫族憑藉自身掌控天地間的力量進行爭鬥；妖族憑藉先天、後天法寶和自身修行進行戰鬥，雙方誰也奈何不了誰，這場巫妖之間進行的戰爭就這樣持續了數年，二族元氣都是大傷，但都不肯就這麼結束戰爭，猶在各自堅持。只是這場巫妖大戰使洪荒天地間的生靈死傷無數，一眼望去，整個洪荒大陸哀鴻遍野，滿目瘡痍，破敗的不成樣子，無數的山峰被移爲平地，無數的河流、湖泊乾涸，又有本不該出現的地方出現了很多湖泊、河流，那都是巫妖二族爭鬥之時隨手打出來的，無數巫族、妖族無家可歸，浪跡在部落中、深山裡獨自喘息。此時，沒有輪迴之所，巫族死了，化身天地；妖族死了，魂魄無依，因此，大陸之上，數以萬計的妖族無神、魂魄無處可歸，只能在這洪荒大陸之上苟且偷生，一不小心，被邪惡的修行者抓住便會被煉成丹藥或煉成器靈，痛苦無比。
就在巫族、妖族雙方僵持不下的時候，紅雲來到了紫宵宮，懇請道祖鴻鈞慈悲爲懷，以天下蒼生爲念，制止巫妖二族的戰爭。此是紅雲知道巫妖二族氣數未盡，人族尚未出世，巫妖二族仍是那洪荒大陸的主角，故纔有紫宵宮一行。鴻鈞看着紅雲，知道紅雲已然成聖，卻仍已天下蒼生爲懷，心俱善念，眼裡盡一片馨慰，且知巫妖二族氣數未盡，遂答應了制止巫族再戰，發出詔令：“從此妖族管天，巫族管地，不許再行廝殺。”接着，鴻鈞又以力，將巫族、妖族衆路大神及數以千萬計的巫衆、妖兵俱送回各自部落、宮殿。只留下了滿目瘡痍的戰場和無數無所歸依的元神、魂魄。