形式越來越急迫了，毛文龍不得不決斷了。
依毛文龍的脾氣，殺了袁崇煥也無不可。但是袁某人是朝廷的督師，朝廷大員，殺了袁崇煥更坐實了“毛文龍擁兵自重，圖謀不軌”的罪名，這本是登萊總兵楊國棟和袁崇煥欲加於毛文龍之大罪，不是給人口實嗎？不造反也是造反了。
對袁崇煥逆來順受，更不可能，袁崇煥已經舉起屠刀，據說還是後金提出的議和條件，不殺毛文龍，袁崇煥無法與後金議和。“議和”是袁崇煥的當前大計，所以他是非殺毛文龍不可的。
真的就應了那密信的話，只有告病還鄉，交出權力和軍隊。即便如此，是否遂了袁崇煥之心還未可知？
毛文龍和他的親信們最後商議的結果是：
毛文龍給朝廷發一封奏摺，說明事情原委，特別點出對後金議和是寵慣賊寇的行爲，絕無好結果。毛文龍父子交出所有權力和軍隊，辭去官職，告病還鄉。奏摺秘密走水路送達南京兵部，轉交北京朝廷。如果直接送往北京要經過山東登萊總兵楊國棟的地盤，走大沽口更是袁崇煥的天下，均不可能安全送達朝廷。
明朝有兩個都城，這在歷史上是很獨特的現象。永樂十九年（公元1421年），明成祖遷都北京，改南京爲留都。南京除了沒有皇帝之外，其他各種官僚機構的設置完全和北京一樣。南京所設立之六部稱“南六部”，雖同有一套職官，但多安置閒散退休或被排斥的官員，其職權遠不如北京六部。所以，南京各官自成一種勢力，與北京明爭暗鬥，兩京官員迭爲消長，操縱朝局。這是明代的一種奇特現象。南京有隻有爲數不多的幾個有實權的部門，像南京兵部、南京守備太監、操江提督、錦衣衛的南鎮撫司等，其他都是虛職。
毛文龍把東江軍隊分爲五個協，分別由劉興祚、耿仲明、林茂春、孔有德、曲承恩，五人臨時分別看守管理，等待朝廷命令。
五月二十八，袁崇煥到達雙島（金州海外西南），隨即傳毛文龍到雙島。
事急矣。毛文龍傳令安排船隻，做好出海準備。
六月初一夜間，由李、王兩位師爺各執一份相同的奏摺，分乘兩艘快船，扮作行商，乘夜色分批出發，每船派家丁10人護送。先到達南京的則將奏摺遞交南京兵部。
六月初三，袁崇煥催促公文又到。並質問抓捕關寧水兵之事。毛文龍不得不行動了。當日將隨行物品搬運上船，家眷和隨行家丁同時上船。安置就緒。
六月初四凌晨，毛文龍傳令：到中午時分，釋放拘捕的關寧水軍兵丁；府中大堂上，留下告病公文。毛文龍父子登上兵船，懸掛出左都督旗幟，卯初（凌晨5點）拔錨起航，南下返鄉，連
同護送兵船共10艘，組成臨時艦隊，取皮島路徑，然後，直航杭州。
東江軍的戰艦不是很多，這10艘船幾乎是東江軍的所有家底了。由於後金基本沒有海上力量，所以處於前線的幾支部隊，如東江鎮、關寧、登萊水上力量都不是很強。
中國畢竟是大國，說海軍力量不強，僅僅是相對大國地位而言。周圍的小國，像日本、朝鮮、琉球甚至西方已經到達亞洲的航海列強也是惹不起的。東江鎮、關寧、登萊有北方的海軍力量，南京也有水軍，福建的海軍最強，主要是歸降朝廷的鄭芝龍部，當時的海上強國荷蘭都是手下敗將。南海瓊州還有海軍。在中國近海大明朝廷不懼任何敵人，只是不能到遠洋爭霸罷了。
......
袁崇煥得到毛文龍出走的消息已經是中午時分。毛文龍已經走了三個時辰（6個小時）了，而且是一路向東偏北（皮島方向），風向側風，已經走出數百里了。
袁崇煥氣急敗壞，手中的精緻茶杯摔得粉碎，雙島在金州半島（遼東半島）的西側，毛文龍從半島東側出海向東航行，袁崇煥要追必須繞過半島，這又增加了100多裡。多快的船也追不上了。雖然袁崇煥事先在東邊佈置了六艘兵艦，是用來防備毛文龍逃跑的。那只是防備毛文龍狼狽逃竄，而不是有計劃的逃跑。關寧軍水軍的船隻、裝備強於東江水軍，但是士兵的戰鬥力是比不上東江水軍的。如果用六艘對東江軍十艘兵船絕對是敗仗。
袁崇煥的判斷很正確，毛文龍的十艘船一出海，就碰上了預先埋伏於此的六艘戰艦。這六艘戰艦上，掛有關寧水軍的旗幟，見來船上有毛文龍的左都督旗幟就包抄上來，並打出旗號勒令停船檢查，這六艘船隻有一艘大船，大約一千料，其餘都是500料以下的小船。
這個時代的海戰，跳幫作戰還是很常見的戰法，就像陸戰中的拼刺刀。雙方的戰船都只有部分船隻安裝了火炮，其他船上僅有手拿弓箭和大刀長矛等待跳幫的士兵。
毛文龍一方的官兵都很氣憤，明明懸掛左都督的旗幟還敢阻攔，真是不要命了。毛文龍的坐船2000料，另有三條1000料的大船，這三艘戰艦是東江水軍的主力戰艦，都裝有數十門火炮，其餘也在500料以上，火炮較少，有的船根本就沒有火炮。東江軍戰鬥力遠強於關寧軍。
毛文龍命令戰艦排成斜線迎戰隊形，距離一里（500米）之外不準開炮。紅衣大炮可以打八到十里，毛文龍的船上沒有紅衣大炮，有幾門佛郎機炮，大部分都是1000斤以下的火炮，木製戰艦上承受的後坐力有限，這些船隻承受不了更大的火炮。這些炮，最大射程三到五里，這些都是鑄造的滑膛炮，打出去的
是個鐵嘎達，能打三、五里不假，沒有任何準頭，到了一里之內，炮的準確性就有了，攻擊力度也大，雖然海戰不多，但是，毛文龍經常打仗，知道這些，所以寧可捱上幾炮，也要等近了再打。
關寧軍一方很囂張，也許仗着袁崇煥的上官命令，也許是不懂海戰，明明處於劣勢，還是把六艘戰艦排了個倒雁翅陣型，包抄着就衝上來了。好像生怕對方漏網跑掉似的。雙方對面行駛很快進入了五里以內，關寧一方先開火了，隨着“轟！轟！”的炮聲，炮彈在前方落水，激起沖天的水柱，顯然開炮太早了，射程不夠，看來對方也沒有紅衣大炮。隨着距離拉近，炮彈落點開始接近。到了接近兩裡的距離時，關寧水軍的船都來一個側轉，露出船側舷的火炮，大船一側有十門左右，小船也有三四門炮，有兩艘小船沒有火炮。十幾門大炮一同開火，聲勢也是不小，只是效果太差。東江水軍的船還是正面行駛，迎面面積小，加上炮彈不準，基本上都打到水裡，但是，總有個別炮彈命中，也是打得風帆翻滾，木屑橫飛。關寧軍的指揮官也納悶，對方直撞過來，就是不開火，沒有大炮？撞船？可能是，他們的船大。接舷跳幫？對，有這個可能，他們穿多人也多。正要下令：保持距離，避免衝撞時，對方的船轉身了，露出側舷的火炮，這時雙方距離大約一里（500米），十艘戰艦，數十門火炮同時開火，炮聲震天，頭一輪炮就使不少船隻中彈，那艘1000料的大船被重點照顧，船頭側面吃水線的位置，被打了個大洞，海水灌入船中，船開始減速。呼呼的鏈彈，把風帆攪得亂七八糟。其他船隻也有挨炮彈的，但是都不嚴重。
俗話說，趁你病，要你命，東江軍的三艘主力戰艦都湊過來，這時距離已經不足一里，一頓炮彈，把這艘船打了個千瘡百孔。眼看着側傾翹頭，一下子就坐到海底去了。船沉得太快，只有少數人來得及跳海逃生。
一看形勢不對，對方動了真格的，真敢打，指揮船沉了，剩下的五艘小船掉頭就跑，也顧不得救人了。毛文龍命令不要追擊，打撈落水者，統計戰損。
己方的損失報上來了。戰船輕傷一艘，副桅杆打斷可以維修，其餘都是風帆受損，可以更換或修補，陣亡六人，被炮彈打中頭部或要害部位，傷21人，已經救治，其中重傷三人。
敵方，擊沉一艘1000料的戰艦，陣亡預計七八十人，多爲沉船速度太快，沒跑出來，俘虜14人（打撈上來的）。
毛文龍下令修補船上桅杆，關押審訊俘虜，休整後，繼續開往皮島方向。皮島是東江軍的重要據點，後事需要安排妥當，跟隨多年的部下也要見一面，有所囑託。
--- 第53章完 ---
（本章完）